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{{Command|qiime --help}} | {{Command|qiime --help}} | ||
{{Callout | {{Callout | ||
|title=Note | |title=Note | ||
|content=Étant donné que la commande < | |content=Étant donné que la commande <code>qiime</code> appelle un conteneur, il se peut que vous deviez définir la variable d'environnement <code>APPTAINER_BIND</code> pour ... des répertoires particuliers dans ce conteneur pour avoir accès à vos données, par exemple <code>APPTAINER_BIND=/home qiime ...</code> | ||
}} | }} | ||
==Installation == | ==Installation == | ||
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</pre> | </pre> | ||
Notez qu'il est important d'utiliser l'option [[Apptainer/fr#Bind_mount|bind]] (<code>-B</code>) avec chacun des répertoires avec lesquels vous voulez travailler quand des programmes sont exécutés dans votre conteneur. Pour plus d'information, voyez ce [https://www.youtube.com/watch?v=bpmrfVqBowY webinaire Apptainer]. | |||
Notez qu'il est important d'utiliser l'option [[Apptainer/fr#Bind_mount|bind]] (<code>-B</code>) avec chacun des répertoires avec lesquels vous voulez travailler quand des programmes sont exécutés dans votre conteneur. Pour plus d'information, voyez | |||
La première fois que des données sont importées en format QIIME, vous pourriez recevoir un message semblable à | La première fois que des données sont importées en format QIIME, vous pourriez recevoir un message semblable à |