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Standard software environments/fr: Difference between revisions
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La couche de compatibilité est un niveau de la hiérarchie en dessous de celui des compilateurs et des paquets logiciels pour que ces derniers soient indépendants du système d’exploitation sous-jacent et qu’ils fonctionnent autant sous CentOS que sous Ubuntu ou Fedora.Un changement majeur dans la version 2020 a été de changer d'outil pour la couche de compatibilité en passant de [https://en.wikipedia.org/wiki/Nix_package_manager Nix package manager] à [https://wiki.gentoo.org/wiki/Project:Prefix Gentoo Prefix]. | La couche de compatibilité est un niveau de la hiérarchie en dessous de celui des compilateurs et des paquets logiciels pour que ces derniers soient indépendants du système d’exploitation sous-jacent et qu’ils fonctionnent autant sous CentOS que sous Ubuntu ou Fedora.Un changement majeur dans la version 2020 a été de changer d'outil pour la couche de compatibilité en passant de [https://en.wikipedia.org/wiki/Nix_package_manager Nix package manager] à [https://wiki.gentoo.org/wiki/Project:Prefix Gentoo Prefix]. | ||
====Noyau Linux==== | |||
===Noyau Linux=== | |||
Les versions 2016.4 et 2018.3 nécessitent une version du noyau Linux 2.6.32 ou plus, ce qui est supporté à partir de CentOS 6. La version 2020 demande un noyau Linux 3.10 ou plus, ce qui est supporté à partir de CentOS 7. Les autres distributions Linux ont habituellement un noyau beaucoup plus récent et vous n’aurez donc pas à changer votre distribution Linux si vous utilisez cet environnement standard sous une autre que CentOS. | Les versions 2016.4 et 2018.3 nécessitent une version du noyau Linux 2.6.32 ou plus, ce qui est supporté à partir de CentOS 6. La version 2020 demande un noyau Linux 3.10 ou plus, ce qui est supporté à partir de CentOS 7. Les autres distributions Linux ont habituellement un noyau beaucoup plus récent et vous n’aurez donc pas à changer votre distribution Linux si vous utilisez cet environnement standard sous une autre que CentOS. | ||
==== Extensions de modules ==== | |||
=== Extensions de modules === | |||
Avec l'environnement 2020, nous avons commencé à installer plusieurs extensions Python dans les modules principaux correspondants. Par exemple, <tt>PyQt5</tt> a été installé dans le module <tt>qt/5.12.8</tt> pour supporter plusieurs versions de Python. Le système des modules a été modifié pour vous permettre de trouver facilement ce type d'extensions. Par exemple, avec | Avec l'environnement 2020, nous avons commencé à installer plusieurs extensions Python dans les modules principaux correspondants. Par exemple, <tt>PyQt5</tt> a été installé dans le module <tt>qt/5.12.8</tt> pour supporter plusieurs versions de Python. Le système des modules a été modifié pour vous permettre de trouver facilement ce type d'extensions. Par exemple, avec | ||
{{Command|module spider pyqt5}} | {{Command|module spider pyqt5}} | ||
vous saurez que vous pouvez obtenir le module <tt>qt/5.12.8</tt>. | vous saurez que vous pouvez obtenir le module <tt>qt/5.12.8</tt>. | ||
=== <code>StdEnv/2018.3</code> === | |||
== <code>StdEnv/2018.3</code> == | |||
{{Template:Warning | {{Template:Warning | ||
|title=Obsolète | |title=Obsolète | ||
|content=Cet environnement n'est plus supporté.}} | |content=Cet environnement n'est plus supporté.}} | ||
Cette deuxième version de notre environnement logiciel a été installée en 2018, avec la mise en service de la grappe [[Béluga]], peu après le déploiement de [Niagara/fr|Niagara]. Les compilateurs par défaut sont passés à GCC 7.3.0 et Intel 2018.3. L’implémentation MPI par défaut est passée à Open MPI 3.1.2. Il s’agit de la première version à offrir le support des instructions AVX512. | Cette deuxième version de notre environnement logiciel a été installée en 2018, avec la mise en service de la grappe [[Béluga]], peu après le déploiement de [Niagara/fr|Niagara]. Les compilateurs par défaut sont passés à GCC 7.3.0 et Intel 2018.3. L’implémentation MPI par défaut est passée à Open MPI 3.1.2. Il s’agit de la première version à offrir le support des instructions AVX512. | ||
Activez cet environnement avec la commande | Activez cet environnement avec la commande | ||
{{Command|module load StdEnv/2018.3}} | {{Command|module load StdEnv/2018.3}} | ||
=== <code>StdEnv/2016.4</code> === | |||
== <code>StdEnv/2016.4</code> == | |||
{{Template:Warning | {{Template:Warning | ||
|title=Obsolète | |title=Obsolète | ||
|content=Cet environnement n'est plus supporté.}} | |content=Cet environnement n'est plus supporté.}} | ||
Cette première version de notre environnement logiciel a été installée en 2016 avec la mise en service des grappes [Cedar/fr|Cedar] et [Graham/fr|Graham]. Les compilateurs par défaut sont GCC 5.4.0 et Intel 2016.4. L’implémentation MPI par défaut est Open MPI 2.1.1. La plupart des logiciels compilés dans cet environnement ne supportent pas les instructions AVX512, contrairement aux processeurs Skylake de [[Béluga]], [Niagara/fr|Niagara] et aux récents ajouts à Cedar et Graham. | Cette première version de notre environnement logiciel a été installée en 2016 avec la mise en service des grappes [Cedar/fr|Cedar] et [Graham/fr|Graham]. Les compilateurs par défaut sont GCC 5.4.0 et Intel 2016.4. L’implémentation MPI par défaut est Open MPI 2.1.1. La plupart des logiciels compilés dans cet environnement ne supportent pas les instructions AVX512, contrairement aux processeurs Skylake de [[Béluga]], [Niagara/fr|Niagara] et aux récents ajouts à Cedar et Graham. | ||
Activez cet environnement avec la commande | Activez cet environnement avec la commande | ||
{{Command|module load StdEnv/2016.4}} | {{Command|module load StdEnv/2016.4}} | ||