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* [http://www.plumed-code.org PLUMED], bibliothèque de code pour le développement relatif au calcul de l'énergie libre dans les simulations en dynamique moléculaire (voir aussi [[GROMACS/fr|GROMACS]]) | * [http://www.plumed-code.org PLUMED], bibliothèque de code pour le développement relatif au calcul de l'énergie libre dans les simulations en dynamique moléculaire (voir aussi [[GROMACS/fr|GROMACS]]) | ||
* [https://www.rosettacommons.org Rosetta] | * [https://www.rosettacommons.org Rosetta] | ||
* [https://swift.cmbi.umcn.nl/gv/dssp/ DSSP] | |||
* [[VMD/fr|VMD]] | * [[VMD/fr|VMD]] | ||