Narval
| Disponibilité : octobre 2021 |
| Nœud frontal : sera bientôt annoncé |
| Point de chute Globus : sera bientôt annoncé |
| Nœud de copie (rsync, scp, sftp,...) : sera bientôt annoncé |
Narval est une grappe hétérogène et polyvalente conçue pour une grande variété de calculs scientifiques de petite et moyenne taille. Narval est située à l'École de technologie supérieure. Son nom rappelle le narval, un mammifère marin qui a parfois été observé dans les eaux du fleuve Saint-Laurent.
Particularités[edit]
Notre politique veut que les nœuds de calcul de Narval n'aient pas accès à l'internet. Pour y faire exception, veuillez joindre le soutien technique en expliquant ce dont vous avez besoin et pourquoi. Notez que l'outil crontab n'est pas offert.
Chaque tâche devrait être d'une durée d’au moins une heure (au moins cinq minutes pour les tâches de test) et vous ne pouvez avoir avoir plus de 1000 tâches (en exécution et en attente) à la fois. La durée maximale d'une tâche est de 7 jours (168 heures).
Stockage[edit]
| HOME Système de fichiers Lustre, ~100 To d’espace au total |
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| SCRATCH Système de fichiers Lustre, ~5 Po d’espace au total |
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| PROJECT Système de fichiers Lustre, ~15 Po d’espace au total |
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Au tout début de la présente page, un tableau indique plusieurs adresses de connexion. Pour les transferts de données par Globus, il faut utiliser le Point de chute Globus. Par contre, pour les outils comme rsync et scp, il faut utiliser l'adresse du Nœud de copie.
Réseautique haute performance[edit]
Le réseau InfiniBand HDR de Mellanox relie tous les nœuds de la grappe. Chaque commutateur de 40 ports HDR (200 Gb/s) permet de connecter ensemble jusqu'à 66 nœuds en HDR100 (100 Gb/s) avec 33 liens HDR divisés en deux (2) par des câbles spéciaux. Les sept (7) liens HDR restants servent à connecter le commutateur d'un cabinet à chacun des sept (7) commutateurs HDR du réseau InfiniBand central. Les îlots de nœuds sont donc connectés avec un facteur de blocage maximum de 33:7 (4.7:1). Par contre, les serveurs de stockage sont branchés avec un facteur de blocage significativement plus bas pour une performance maximale.
En pratique, les cabinets de Narval contiennent des îlots de 48 ou 56 nœuds CPU réguliers. Il est donc possible d'exécuter des tâches parallèles utilisant jusqu’à 3584 cœurs et une réseautique non bloquante. Pour des tâches plus imposantes ou plus fragmentées sur le réseau, le facteur de blocage est de 4.7:1. L’interconnexion reste malgré tout de haute performance.
Caractéristiques des nœuds[edit]
| nœuds | cœurs | mémoire disponible | CPU | stockage | GPU |
|---|---|---|---|---|---|
| 1109 | 64 | ~256000M | 2 x AMD Rome 7532 @ 2.40 GHz 256M cache L3 | 1 x SSD de 960G | - |
| 33 | ~2048000M | ||||
| 158 | 48 | ~512000M | 2 x AMD Milan 7413 @ 2.65 GHz 128M cache L3 | 1 x SSD de 3.84T | 4 x NVidia A100 (mémoire 40G) |
Particularités liées aux processeurs AMD[edit]
Ensemble d'instructions supporté[edit]
Narval est équipé de processeurs AMD qui supportent les instructions AVX2. Cet ensemble d'instructions est le même qui est supporté par les CPUs Intel de la génération Haswell, trouvés sur Graham et sur les noeuds les plus anciens de Cedar. Les processeurs de Narval ne supportent pas l'ensemble d'instructions AVX512, supporté par les processeurs Intel de la génération Skylake, qui sont utilisés sur Béluga, Niagara, ainsi que sur les noeuds les plus récents de Cedar.
Compilation avec le compilateur Intel[edit]
Les compilateurs Intel peuvent compiler du code pour les processeurs AMD en utilisant l'ensemble d'instructions AVX2. Par contre, si vous avez compilé un code sur un système utilisant des processeurs Intel, et que vous avez utilisé les options -xXXXX, tels que -xHost, ou -xCORE-AVX2, ceux-ci ne fonctionneront pas, car les compilateurs Intel ajoutent des instructions pour vérifier que le CPU utilisé est produit par Intel. Afin d'obtenir des exécutables qui sont compatibles à la fois avec les processeurs Intel et AMD, il faut plutôt utiliser l'option -march=core-avx2.
Environnements logiciels disponibles[edit]
L'environnement logiciel standard StdEnv/2020 est l'environnement par défaut sur Narval. Les anciennes versions ont été volontairement bloquées. Si vous avez besoin d'un logiciel qui n'est disponible que sur une ancienne version de l'environnement standard, nous vous invitons à contacter notre soutien technique.
Bibliothèques BLAS et LAPACK[edit]
La bibliothèque Intel MKL fonctionne sur les processeurs AMD, mais elle n'est pas optimale. Nous étudions présentement l'option d'utiliser la bibliothèque FlexiBLAS pour l'installation de prochaines versions de logiciel, afin de pouvoir changer dynamiquement l'implémentation de BLAS et LAPACK qui est utilisée, en fonction du vendeur du processeur. Si vous croyez que le code que vous exécutez est particulièrement sensible à la performance de BLAS et LAPACK, nous vous invitons à contacter notre soutien technique.