PGDBG
Description
PGDBG est un outil simple mais puissant pour le débogage d’applications parallèles MPI et OpenMP sous Linux. L’outil fait partie du paquet du compilateur PGI et est configuré pour OpenMP avec fils parallèles. Il peut être utilisé en mode graphique avec redirection X11 ou en mode ligne de commande.
Un débogueur GNU comme GDB conviendra pour la plupart des programmes C, C++ ou Fortran77. Cependant, GDB ne fonctionne pas très bien avec les programmes Fortran 90/95; c’est pourquoi le Portland Group a développé pgdbg.
Guide de démarrage
Le travail avec PFDBG s’effectue généralement en deux étapes :
- compilation : le code est compilé (avec l’option -g pour obtenir les symboles de débogage);
- exécution et débogage : le code est exécuté et les résultats sont analysés.
Le débogage peut se faire en mode ligne de commande ou en mode graphique.
Modules d’environnement
Il faut d’abord charger le module pour le paquet PGI. Pour connaître les versions disponibles pour les modules du compilateur, de MPI et de CUDA que vous avez chargés, lancez module avail pgi. Pour connaître la liste complète des modules PGI disponibles, lancez module -r spider '.*pgi.*'. En date de décembre 2018, les versions disponibles sont
- pgi/13.10
- pgi/17.3
Pour charger un module, lancez module load pgi/version; par exemple, pour la version 17.3, la commande est
[name@server ~]$ module load pgi/17.3
Compilation
Avant d’être débogué, le code doit d’abord être compilé en ajoutant l’indicateur -g pour obtenir les renseignements utiles au débogage.
[name@server ~]$ pgcc -g program.c -o program
Exécution et débogage en mode ligne de commande
Une fois le code compilé avec les options appropriées, lancez PGDBG pour effectuer l’analyse. Par défaut, l’affichage se fait par l’interface graphique. Si toutefois vous ne voulez pas utiliser cette interface ou que vous n’avez pas la redirection X11, vous pouvez travailler en mode ligne de commande en ajoutant l’option text au lancement de PDGDB.
En mode ligne de commande, une invite est affichée.
[name@server ~]$ pgdbg -text program
PGDBG 17.3-0 x86-64 (Cluster, 256 Process)
PGI Compilers and Tools
Copyright (c) 2017, NVIDIA CORPORATION. All rights reserved.
Loaded: /home/user/program
pgdbg>
À l’invite, lancez la commande run.
[name@server ~]$
pgdbg> run
En cours d’exécution du programme, PGDBG s’attache automatiquement aux fils et décrit chacun d’eux au fur et à mesure qu’ils sont créés. En cours de débogage, PGDBG travaille sur un seul fil à la fois, le fil courant. La commande thread sert à sélectionner le fil courant, la commande threads liste les fils utilisés à ce moment par un programme actif.
[name@server ~]$ pgdbg > threads
0 ID PID STATE SIGNAL LOCATION
3 18399 Stopped SIGTRAP main line: 31 in "omp.c" address: 0x80490ab
=> 2 18398 Stopped SIGTRAP main line: 32 in "omp.c" address: 0x80490cf
1 18397 Stopped SIGTRAP main line: 31 in "omp.c" address: 0x80490ab
0 18395 Stopped SIGTRAP f line: 5 in "omp.c" address: 0x8048fa0
Par exemple, pour sélectionner ID 2 comme fil courant, la commande thread serait
[name@server ~]$ pgdbg > thread 3
pgdbg > threads
0 ID PID STATE SIGNAL LOCATION
=> 3 18399 Stopped SIGTRAP main line: 31 in "omp.c" address: 0x80490ab
2 18398 Stopped SIGTRAP main line: 32 in "omp.c" address: 0x80490cf
1 18397 Stopped SIGTRAP main line: 31 in "omp.c" address: 0x80490ab
0 18395 Stopped SIGTRAP f line: 5 in "omp.c" address: 0x8048fa0
Exécution et débogage en mode graphique
L’interface graphique est utilisée par défaut. Si vous avez configuré la redirection X11, PGDBG démarre en mode graphique dans une nouvelle fenêtre.
Les éléments de l'interface graphique sont :
- barre de menus
- barre d'outils
- panneau code source
- panneau I/O
- panneau onglets de débogage.
La barre de menus principale affiche File, Edit, View, Connections, Debug et Help. Il est possible de naviguer avec la souris ou avec les raccourcis-clavier.
Barre d'outils principale
La barre d'outils principale contient plusieurs boutons et quatre listes déroulantes. La première liste Current Process, montre le processus en cours, autrement dit, le fil courant. Le libellé change selon que le processus ou le fil est décrit. Quand plusieurs fils sont disponibles, cette liste sert à sélectionner le processus ou le fil qui devrait être courant.
La deuxième liste Apply détermine le groupe de processus et de fils auxquels les commandes d'action s'appliquent.
La troisième liste Display détermine le groupe de processus et de fils auxquels les commandes d'affichage de données s'appliquent.
La quatrième liste File affiche le fichier source qui contient la cible courante.
Panneau pour le code source
The source window (shown on the figure below) and all of the debug information tabs are dockable tabs, meaning that they can be taken apart from the main window. This can be done by double-clicking the tab. The source window shows the source code for the current session.
Program I/O Window
Program output is displayed in the Program IO tab’s central window. Program input is entered into this tab’s Input field.
Debug information tab
Debug information tabs take up the lower half of the debugger GUI. Each of these tabs provides a particular function or view of debug information. The following sections discuss the tabs as they appear from left-to-right in the GUI’s default configuration.