Bio-informatique
This site replaces the former Compute Canada documentation site, and is now being managed by the Digital Research Alliance of Canada. Ce site remplace l'ancien site de documentation de Calcul Canada et est maintenant géré par l'Alliance de recherche numérique du Canada. |
This is not a complete article: This is a Draft, a work in progress that is intended to be published into an article, which may or may not be ready for inclusion in the main wiki. It should not necessarily be considered factual or authoritative.
Logiciels disponibles
Voyez la liste des modules disponibles sur nos grappes. Cliquez sur l'entête de la colonne Type; le type bio identifie les applications en bio-informatique.
Toutefois, cette liste ne présente pas les paquets Python que vous trouverez dans notre page Wheels Python.
Données
Certaines bases de données de génomes sont disponibles dans /cvmfs/ref.mugqic/genomes
.
Dans ce répertoire et ses sous-répertoires, faites une recherche avec, par exemple
[name@server ~]$ ls /cvmfs/ref.mugqic/genomes
ou
[name@server ~]$ ls /cvmfs/ref.mugqic/genomes/species
Container repository
The Bioinformatics National Team maintains a repository of Apptainer (formerly Singularity) containers which provide common workflows and those workflows requiring preservation. Learn more at Biorepo Containers.