Bio-informatique
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Logiciels disponibles
Voyez la liste des modules disponibles sur nos grappes. Cliquez sur l'entête de la colonne Type; le type bio identifie les applications en bio-informatique.
Toutefois, cette liste ne présente pas les paquets Python que vous trouverez dans notre page Wheels Python.
Données
Certaines bases de données de génomes sont disponibles dans /cvmfs/ref.mugqic/genomes.
Dans ce répertoire et ses sous-répertoires, faites une recherche avec, par exemple
[name@server ~]$ ls /cvmfs/ref.mugqic/genomes
ou
[name@server ~]$ ls /cvmfs/ref.mugqic/genomes/species
Container repository
The Bioinformatics National Team maintains a repository of Apptainer (formerly Singularity) containers which provide common workflows and those workflows requiring preservation. Learn more at Biorepo Containers.