Gaussian ː Messages d’erreur

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Page enfant de Gaussian

Cette information a été initialement compilée par le professeur Cory C. Pye.

Normal termination of Gaussian

En conditions d'exécution normale, Gaussian termine comme suit ː 

 Job cpu time:       0 days  0 hours 26 minutes 18.3 seconds.
 Elapsed time:       0 days  0 hours  6 minutes 43.3 seconds.
 Normal termination of Gaussian 16 at Tue Nov 14 15:31:56 2017.

Si la tâche échoue sans produire de message d’erreur et que le rapport de sortie semble autrement normal, ceci peut éventuellement indiquer que :

  • votre quota a été dépassé (voir Quotas et politiques);
  • le temps d’exécution a été plus long que le temps demandé à (voir l'ordonnanceur) (--time=HH:MM:SS);
  • la mémoire demandée est insuffisante (voir Suivi des tâches); ou
  • votre tâche produit des données dont la taille dépasse la capacité du disque local des nœuds de calcul.

Erroneous Write

Description

Vers la fin du fichier de sortie, on peut lire une variante de 

Erroneous write. write 122880 instead of 4239360.
fd = 3
Erroneous write. write 122880 instead of 4239360.
fd = 3
writwa
writwa: File exists

ou 

Erroneous write. write -1 instead of 3648000. 

fd = 4
writwa
writwa: No space left on device

or 

Erroneous write during file extend. write -1 instead of 8192
Probably out of disk space.
Write error in NtrExt1
Cause

Cette erreur se produit habituellement quand l’espace disque est épuisé. L’erreur peut se produire si vous avez dépassé votre quota, si le disque est à pleine capacité ou, dans le cas plus rare où un lecteur de réseau n’est pas disponible en raison d’une interruption de la communication.

Solution
  • Vérifiez votre quota avec quota; au besoin, supprimez les fichiers qui ne sont pas nécessaires.
  • Il se peut que votre tâche soit trop volumineuse pour être exécutée sur le matériel; essayez de réduire la base.

Link 9999

Description

À la fin du fichier de sortie, on peut lire une variante de 

 Error termination request processed by link 9999.
 Error termination via Lnk1e in /disc30/g98/l9999.exe.

Quelques pages plus haut, on peut lire une variante de 

 Maximum Force            0.020301     0.000450     NO 
 RMS     Force            0.007068     0.000300     NO 
 Maximum Displacement     0.078972     0.001800     NO 
 RMS     Displacement     0.023716     0.001200     NO 
 Predicted change in Energy=-3.132299D-05
 Optimization stopped.
    -- Number of steps exceeded,  NStep=  34
    -- Flag reset to prevent archiving.
                       ----------------------------
                       ! Non-Optimized Parameters !
                       ! (Angstroms and Degrees)  !
Cause

La tâche s’est terminée de façon anormale dû à une raison interne à l’application. La cause la plus fréquente est la non-convergence d’une optimisation géométrique.

Solution
  • Optimisez la structure de départ sur la base d’un niveau théorique plus bas. Toutefois, si le visualiseur montre une convergence comme vous la souhaitez, redémarrez l’optimisation à partir de la dernière étape en utilisant par exemple geom=allcheck dans la ligne spécifiant la direction. Il serait peut-être bon d’utiliser opt=CalcFC si ce n’est pas trop coûteux, ce qui est probablement le cas aux niveaux HF ou DFT.
  • Utilisez une matrice hessienne de constantes de force plus riche. Ce serait généralement le cas si les constantes de force varient beaucoup d’un niveau à l’autre, ou s’il y a un changement géométrique important à l’optimisation. Une série de tâches liées peut être exécutée avec --Link1--. Si vous avez une tâche précédente, Opt=ReadFC donnera habituellement de bons résultats, mais occasionnellement aussi Opt=CalcFC et plus rarement Opt=CalcAll. Dans ces cas, les forces sont souvent convergentes, mais les incréments ne le sont pas, ce qui donne
         Item               Value     Threshold  Converged?
 Maximum Force            0.000401     0.000450     YES
 RMS     Force            0.000178     0.000300     YES
 Maximum Displacement     0.010503     0.001800     NO 
 RMS     Displacement     0.003163     0.001200     NO
  • À l’occasion, le problème vient du système de coordonnées, surtout avec une Z-matrice où il est facile de faire de mauvais choix. Dans plusieurs cas, trois des quatre atomes utilisés pour définir l’angle dièdre peuvent se retrouver colinéaires, c’est-à-dire que l’angle est près de 0 ou 180 degrés, ce qui peut faire échouer l’algorithme. Vous pouvez soit modifier votre Z-matrice ou utiliser les coordonnées internes redondantes définies par défaut.
  • En dernier recours, remplacez la méthode d’optimisation par défaut par un autre type de méthode, par exemple opt=ef (pour moins de 50 variables) ou opt=gdiis (pour des molécules souples).

angle Alpha is outside the valid range of 0 to 180

Description

À la fin du fichier de sortie, on peut lire une variante de 

 ------------------------------------------------------------------------
 Error termination via Lnk1e in /disc30/g98/l716.exe.

The lines above will be a z-matrix, above which will contain lines such as 

  Error on Z-matrix card number    9
 angle Alpha is outside the valid range of 0 to 180.
 Conversion from Z-matrix to cartesian coordinates failed:
 ------------------------------------------------------------------------
                         Z-MATRIX (ANGSTROMS AND DEGREES)
 CD Cent Atom  N1     Length/X     N2    Alpha/Y     N3     Beta/Z      J
 ------------------------------------------------------------------------
...
  9   9  H     8   0.962154(  8)   1   -1.879( 16)   2    0.000( 23)   0
...
Cause

La tâche s’est terminée de façon anormale parce qu’un des angles X de la Z-matrice s’est trouvé hors des limites permises de 0 < X < 180.

Solution

Ceci peut se produire dans le cas de modifications géométriques importantes dans une molécule, surtout quand elle est composée de fragments en interaction. Redéfinissez la Z-matrice ou utilisez un autre système de coordonnées.

Reading basis center

Description

À la fin du fichier de sortie, on peut lire une variante de 

 End of file reading basis center.
 Error termination via Lnk1e in /disc30/g98/l301.exe.
 Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  1.9 seconds.
 File lengths (MBytes):  RWF=   11 Int=    0 D2E=    0 Chk=   10 Scr=    1
Cause

Il s’agit d’une erreur de saisie. Vous voulez lire une base générale, mais vous avez omis de l’indiquer.

Solution

Entrez la base en question, ou supprimez gen de la ligne pour la route et indiquez une base interne.

Operation on file out of range

Description

À la fin du fichier de sortie, on peut lire une variante de 

 Error termination in NtrErr:
 NtrErr Called from FileIO.

précédée de 

 Operation on file out of range.
FileIO: IOper= 2 IFilNo(1)=-19999 Len=     1829888 IPos=  -900525056 Q=       4352094416

 dumping /fiocom/, unit = 1 NFiles =   109 SizExt =    524288 WInBlk =      1024
                   defal = T LstWrd =  7437256704 FType=2 FMxFil=10000

et suivie de plusieurs nombres.

Solution

Vous utilisez Opt=ReadFC, guess=read ou geom=allcheck/modify pour obtenir du fichier de point de contrôle (checkpoint file) quelque chose qui n’est pas trouvé parce que le calcul ne s’est pas fait ou que l’information est absente du fichier de point de contrôle parce que la tâche précédente n’a pas été complétée par manque de temps ou d’espace disque.

Solution

Reprenez les calculs ou entrez l’information requise.

End of file in GetChg

Description

À la fin du fichier de sortie, on peut lire une variante de 

 Symbolic Z-matrix:
 End of file in GetChg.
 Error termination via Lnk1e in /disc30/g98/l101.exe.
 Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  0.5 seconds.
 File lengths (MBytes):  RWF=    6 Int=    0 D2E=    0 Chk=   11 Scr=    1
Cause

Vous avez omis d’entrer la ligne charge/multiplicity en entrée ou vous vouliez utiliser charge/multiplicity à partir du fichier de contrôle (checkpoint), mais vous avez omis geom=allcheck dans la section pour la route.

Solution

Entrez la ligne charge/multiplicity ou ajoutez geom=allcheck dans la section pour la route.

Change in point group or standard orientation

Description

À la fin du fichier de sortie, on peut lire une variante de 

 Stoichiometry    CdH14O7(2+)
 Framework group  C2[C2(CdO),X(H14O6)]
 Deg. of freedom   30
 Full point group                 C2      NOp   2
 Omega: Change in point group or standard orientation.

 Error termination via Lnk1e in /disc30/g98/l202.exe.
 Job cpu time:  0 days  3 hours 35 minutes 40.8 seconds.
 File lengths (MBytes):  RWF=   58 Int=    0 D2E=    0 Chk=   19 Scr=    1
Cause

L’orientation standard ou le groupe ponctuel de la molécule a été modifié au cours de l’optimisation. Dans ce dernier cas, un programme de visualisation montrera un retournement soudain de la structure, généralement de 180 degrés. Cette erreur se produit moins depuis la version Gaussian 03.

Solution

Votre Z-matrice est peut-être mal définie si vous allez d’un groupe ponctuel à un sous-groupe de ce groupe ponctuel (par exemple de C2v à C2, Cs ou C1).

  • Si le groupe ponctuel est correct, il se pourrait que la symétrie de la structure de départ soit trop élevée et qu’elle doive être diminuée.
  • Dans certains cas rares, le groupe ponctuel est incorrect ou la symétrie est trop élevée; reformulez la Z-matrice avec plus de symétrie.

Si la symétrie n’a pas d’importance, désactivez-la.

Unrecognized atomic symbol

Description

À la fin du fichier de sortie, on peut lire une variante de 

 General basis read from cards:  (6D, 7F)
 Unrecognized atomic symbol ic2 

 Error termination via Lnk1e in /disc30/g98/l301.exe.
 Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  1.6 seconds.
 File lengths (MBytes):  RWF=    6 Int=    0 D2E=    0 Chk=   12 Scr=    1
Cause

La lecture se fait dans une base générale, mais l’atome spécifié (ic2 dans cet exemple) ne correspond à aucun symbole atomique standard. Ceci peut aussi se produire dans une tâche liée si dans une étape précédente des coordonnées par défaut ont été utilisées et ont effacé la Z-matrice alors que vous tentez ensuite de la modifier avec geom=modify. La section des variables est ignorée, mais l’application peut tenter de l’interpréter comme faisant partie de la base.

Solution

Entrez le bon symbole atomique.

Convergence failure -- run terminated

Description

À la fin du fichier de sortie, on peut lire une variante de 

 >>>>>>>>>> Convergence criterion not met.
 SCF Done:  E(RHF) =  -2131.95693715     A.U. after  257 cycles
             Convg  =    0.8831D-03             -V/T =  2.0048
             S**2   =   0.0000
 Convergence failure -- run terminated.
 Error termination via Lnk1e in /disc30/g98/l502.exe.
 Job cpu time:  0 days  0 hours  5 minutes  0.5 seconds.
 File lengths (MBytes):  RWF=   15 Int=    0 D2E=    0 Chk=    8 Scr=    1

ou 

  >>>>>>>>>> Convergence criterion not met.
 SCF Done:  E(UHF) =  -918.564956094     A.U. after   65 cycles
             Convg  =    0.4502D-04             -V/T =  2.0002
             S**2   =   0.8616
 Annihilation of the first spin contaminant:
 S**2 before annihilation     0.8616,   after     0.7531
 Convergence failure -- run terminated.
 Error termination via Lnk1e in /disc30/g98/l502.exe.
 Job cpu time:  0 days  0 hours  3 minutes 56.2 seconds.
 File lengths (MBytes):  RWF=   11 Int=    0 D2E=    0 Chk=    8 Scr=    1
Cause

La procédure SCF (self-consistent field) n’a pas créé la convergence.

Solution
  • Ceci peut se produire quand les orbitales moléculaires ont un guess=read faible.

Essayez d’obtenir un meilleur guess=read (guess=read) en exécutant une procédure SCF avec la même structure de départ, mais avec un niveau théorique plus bas, par exemple HF/STO-3G. Si ceci ne fonctionne pas, utilisez une procédure de convergence différente, comme SCF=QC ou SCF=XQC.

  • Dans certains cas, une faiblesse dans la géométrie peut empêcher la convergence si un des liens est soit beaucoup trop long ou beaucoup trop court. Le problème peut être résolu en modifiant la géométrie initiale.
  • L’erreur peut aussi résulter d’une étape de la procédure d’optimisation qui a été mal effectuée.

Soumettez la tâche de nouveau en utilisant l’avant-dernière géométrie (ou une géométrie antérieure) et une nouvelle évaluation de la matrice hessienne.

FOPT requested but NVar= XX while NDOF= YY

Description

À la fin du fichier de sortie, on peut lire une variante de 

 FOPT requested but NVar= 29 while NDOF= 15.
 Error termination via Lnk1e in /disc30/g98/l202.exe.
 Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  1.3 seconds.
 File lengths (MBytes):  RWF=   11 Int=    0 D2E=    0 Chk=    1 Scr=    1
Cause

Vous avez demandé une optimisation complète (FOpt), incluant une vérification du nombre correct de variables. La vérification a signalé une erreur.

Solution
  • Si NDOF est plus petit que NVar, la molécule est exécutée avec une symétrie inférieure à ce qu’elle est. Augmentez la symétrie.
  • Si NVar est plus petit que NDOF, votre Z-matrice a trop de contraintes pour la symétrie en question.

Le check peut être contourné en utilisant Opt plutôt que FOpt; ceci n’est toutefois pas recommandé.

Unable to project read-in occupied orbitals

Description

À la fin du fichier de sortie, on peut lire une variante de 

 Initial guess read from the checkpoint file:
 BiAq7_3+_C2.chk
 Unable to project full set of read-in orbitals.
 Projecting just the  36 occupied ones.
 Unable to project read-in occupied orbitals.
 Error termination via Lnk1e in /disc30/g98/l401.exe.
 Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes 29.5 seconds.
 File lengths (MBytes):  RWF=   18 Int=    0 D2E=    0 Chk=   17 Scr=    1
Cause

Vous lisez le guess d’une orbitale moléculaire qui provient du fichier de contrôle (checkpoint), mais la projection de l’ancienne base à la nouvelle n’a pas fonctionné. Ceci peut se produire quand certaines bases pseudopotentielles (CEP-121G*) sont utilisées avec des fonctions de polarisation alors qu’aune de ces fonctions n’existe. Dans certains cas, Gaussian utilise des fonctions de polarisation temporaires à exposant zéro.

Solution
  • Utilisez CEP-121G plutôt que CEP-121G*; ils sont les mêmes pour plusieurs éléments.
  • Vous pouvez aussi contourner le problème en évitant d’utiliser le guess.

KLT.ge.NIJTC in GetRSB

Description

À la fin du fichier de sortie, on peut lire une variante de 

 (rs|ai) integrals will be sorted in core.
 KLT.ge.NIJTC in GetRSB.
 Error termination via Lnk1e in /disc30/g98/l906.exe.
 Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes 32.7 seconds.
 File lengths (MBytes):  RWF=  514 Int=    0 D2E=    0 Chk=   10 Scr=    1
Cause

Le calcul MP2 a échoué peut-être en raison du problème de pseudopotentiel mentionné en rapport avec le message d’erreur précédent.

Solution

Utilisez CEP-121G plutôt que CEP-121G*; ils sont les mêmes pour plusieurs éléments.

Symbol XXX not found in Z-matrix

Description

À la fin du fichier de sortie, on peut lire une variante de 

 Symbol "H3NNN" not found in Z-matrix.
 Error termination via Lnk1e in /disc30/g98/l101.exe.
 Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  0.5 seconds.
 File lengths (MBytes):  RWF=    6 Int=    0 D2E=    0 Chk=   14 Scr=    1
Cause

Vous avez entré un nom de variable (ici H3NNN) qui ne se trouve pas dans la Z-matrice.

Solution

Entrez le bon nom de variable ou ajoutez-le à la Z-matrice.

Variable X has invalid number of steps

Description

À la fin du fichier de sortie, on peut lire une variante de 

 Scan the potential surface.
 Variable   Value     No. Steps Step-Size
 -------- ----------- --------- ---------
 Variable  1 has invalid number of steps      -1.
 Error termination via Lnk1e in /disc30/g98/l108.exe.
 Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  0.7 seconds.
 File lengths (MBytes):  RWF=   11 Int=    0 D2E=    0 Chk=   13 Scr=    1
Cause

Il s’agit d’une erreur de saisie. Vous tentez de générer un scan rigide de l’énergie potentielle et il y a probablement deux lignes vides plutôt qu’une entre la Z-matrice et les variables.

Solution

Supprimez la ligne vide.

Problem with the distance matrix

Description

À la fin du fichier de sortie, on peut lire une variante de 

  Problem with the distance matrix.
 Error termination via Lnk1e in /disc30/g98/l202.exe.
 Job cpu time:  0 days  9 hours 11 minutes 14.3 seconds.
 File lengths (MBytes):  RWF=  634 Int=    0 D2E=    0 Chk=   10 Scr=    1
Cause

Il peut s’agir d’une erreur de saisie. Au moins deux atomes sont trop près l’un de l’autre dans cette liste. Il s’agit quelquefois d’une erreur de programmation surtout quand une des distances est NaN (pas un nombre). Ceci peut se produire à l’optimisation de molécules diatomiques quand la distance au départ est trop grande.

Solution

Vérifiez les variables et la Z-matrice des atomes en question pour voir si certains atomes sont trop rapprochés. Ceci pourrait être le résultat de l’absence d’un signe de soustraction dans un angle de torsion pour des molécules ayant des plans symétriques où les atomes reliés ne coïncident pas, c’est-à-dire que la distance entre eux est de zéro.

End of file in ZSymb

Description

À la fin du fichier de sortie, on peut lire une variante de 

 Symbolic Z-matrix:
 Charge =  0 Multiplicity = 1
 End of file in ZSymb.
 Error termination via Lnk1e in /disc30/g98/l101.exe.
 Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  0.6 seconds.
 File lengths (MBytes):  RWF=    6 Int=    0 D2E=    0 Chk=    9 Scr=    1
Cause

Il s’agit d’une erreur de saisie. La matrice est introuvable pour une de ces raisons :

  • Vous avez peut-être omis la ligne vide à la fin des spécifications de géométrie.
  • Vous vouliez obtenir la Z-matrice et les paramètres du fichier de contrôle (checkpoint), mais vous avez oublié d’entrer geom=check.
Solution

Ajoutez une ligne vide à la fin ou ajoutez geom=check.

Linear search skipped for unknown reason

Description

À la fin du fichier de sortie, on peut lire une variante de 

 RFO could not converge Lambda in  999 iterations.
 Linear search skipped for unknown reason.
 Error termination via Lnk1e in /disc30/g98/l103.exe.
 Job cpu time:  0 days  7 hours  9 minutes 17.0 seconds.
 File lengths (MBytes):  RWF=   21 Int=    0 D2E=    0 Chk=    6 Scr=    1
Cause

La RFO (rational function optimization) n’a pas fonctionné pendant une recherche linéaire. La matrice hessienne n’est probablement plus valide.

Solution

Redémarrez l’optimisation avec Opt=CalcFC.

Variable index of 3000 on card XXX is out of range, NVar=XX

Description

À la fin du fichier de sortie, on peut lire une variante de 

 Variable index of 3000 on card  15 is out of range, NVar=  42.
 Termination in UpdVr1.
 Error termination via Lnk1e in /disc30/g98/l101.exe.
 Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  0.5 seconds.
 File lengths (MBytes):  RWF=   11 Int=    0 D2E=    0 Chk=    8 Scr=    1
Cause

Il s’agit d’une erreur de saisie. Vous avez oublié d’ajouter à la liste une variable de votre Z-matrice ; dans cet exemple, la variable définit l’atome numéro 15.

Solution

Ajoutez la variable.

Unknown center XXX

Description

À la fin du fichier de sortie, on peut lire une variante de 

 Unknown center X
 Error termination via Lnk1e in /disc30/g98/l101.exe.
 Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  0.5 seconds.
 File lengths (MBytes):  RWF=    6 Int=    0 D2E=    0 Chk=    8 Scr=    1
Cause

Il s’agit d’une erreur de saisie. Vous tentez de définir un atome dans une Z-matrice en utilisant un autre atome inexistant (X dans cet exemple).

Solution

Utilisez le bon nom d’atome.

Determination of dummy atom variables in z-matrix conversion failed

Description

À la fin du fichier de sortie, on peut lire une variante de 

 Error termination request processed by link 9999.
 Error termination via Lnk1e in /disc30/g98/l9999.exe.
 Job cpu time:  0 days  1 hours 53 minutes 10.4 seconds.
 File lengths (MBytes):  RWF=   20 Int=    0 D2E=    0 Chk=   11 Scr=    1

et juste avant 

 Determination of dummy atom variables in z-matrix conversion failed.
 Determination of dummy atom variables in z-matrix conversion failed.
 NNew=      6.03366976D+01 NOld=      5.07835896D+01 Diff= 9.55D+00
Cause

La conversion des coordonnées internes redondantes à des coordonnées Z-matrice a échoué en raison des atomes fictifs. Vous devrez vous contenter de coordonnées cartésiennes.

Solution

L’optimisation géométrique a convergé, mais Gaussian a été incapable de reconvertir vers la Z-matrice d’entrée.

malloc failed

Description

À la fin du fichier de sortie, on peut lire une variante de 

malloc failed.: Resource temporarily unavailable
malloc failed.
Cause

Il ne s’agit pas d’une erreur Gaussian à proprement parler. Ceci indique un manque de mémoire, peut-être parce que vous avez demandé trop de mémoire sur la ligne %mem.

Solution

Diminuez la valeur de %mem ou augmentez la quantité de mémoire indiquée dans le script de la tâche avec --mem=.

Charge and multiplicity card seems defective

Description

À la fin du fichier de sortie, on peut lire une variante de 

 ----
 -2 1
 ----
 Z-Matrix taken from the checkpoint file:
 oxalate_2-_Aq1_C2.chk
 Charge and multiplicity card seems defective:
 Charge is bogus.
  WANTED AN INTEGER AS INPUT.
  FOUND A STRING AS INPUT.
 CX      =  0.7995                                                              
                                                        
   ?
 Error termination via Lnk1e in /disc30/g98/l101.exe.
Cause

Il s’agit d’une erreur de saisie. En l’absence d’une ligne de titre avec geom=modify, la ligne charge/multiplicity est interprétée comme étant le titre (-2 1 dans cet exemple) et la ligne charge/multiplicity est interprétée comme étant la liste des variables .

Solution

Entrez une ligne de titre.

Attempt to redefine unrecognized symbol "XXXXX"

Description of error

À la fin du fichier de sortie, on peut lire une variante de 

 O2WXC  90. 
 Attempt to redefine unrecognized symbol "O2WXC".
 Error termination via Lnk1e in /disc30/g98/l101.exe.
 Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  0.5 seconds.
 File lengths (MBytes):  RWF=    6 Int=    0 D2E=    0 Chk=    8 Scr=    1
Cause

Il s’agit d’une erreur de saisie. Vous demandez geom=modify, mais une des variables que vous tentez de déplacer ne se trouve pas dans le fichier de contrôle (checkpoint).

Solution

Entrez le bon fichier de contrôle ou la bonne variable.

Inconsistency #2 in MakNEB

Description

À la fin du fichier de sortie, on peut lire une variante de 

 Standard basis: 3-21G (6D, 7F)
 Inconsistency #2 in MakNEB.
 Error termination via Lnk1e in /disc30/g98/l301.exe.
 Job cpu time:  0 days  3 hours 46 minutes 57.4 seconds.
 File lengths (MBytes):  RWF=  245 Int=    0 D2E=    0 Chk=   11 Scr=    1
Cause

Il s’agit d’une erreur de saisie. Le groupe ponctuel a été modifié et vous avez spécifié iop(2/15=4,2/16=2,2/17=7) pour ne pas que le programme plante.

Solution

Soyez très prudent avec iop ou supprimez-le.

galloc: could not allocate memory

Description

Dans le fichier de sortie, on lit 

  galloc: could not allocate memory
Cause

Il s’agit d’une erreur d’allocation en raison du manque de mémoire. Gaussian utilise environ 1Go de plus que %mem.

Solution

La valeur de %mem doit être au moins de 1Go inférieure à la valeur spécifiée dans le script de la tâche. De la même manière, la valeur de --mem spécifiée dans le script doit être au moins de 1Go supérieure à la quantité spécifiée par la directive %mem du fichier d’entrée. L’incrément approprié semble dépendre du type de tâche et des détails dans le fichier d’entrée; 1Go est une valeur conservatrice déterminée de manière empirique.

No such file or directory

Description

Dans le fichier de sortie, on peut lire une variante de 

PGFIO/stdio: No such file or directory
PGFIO-F-/OPEN/unit=11/error code returned by host stdio - 2.
 File name = /home/johndoe/scratch/Gau-12345.inp
 In source file ml0.f, at line number 181
  0  0x42bb41
Error: segmentation violation, address not mapped to object
Cause

Le fichier mentionné dans la troisième ligne n’existe pas possiblement parce que le répertoire qui le contient n’existe pas. Ceci peut se produire par exemple si vous attribuez à GAUSS_SCRDIR un répertoire qui n’existe pas.

Solution

Créez le répertoire avec mkdir ou modifiez la définition de GAUSS_SCRDIR pour utiliser un répertoire existant.

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