Star-CCM+
STAR-CCM+ est une suite logicielle de simulation utilisée dans plusieurs spécialités de génie. Elle permet la modélisation dans des domaines variés dont l'acoustique, la dynamique des fluides, le transfert thermique, la rhéologie, l'écoulement polyphasique, le flux de particules, la mécanique des solides, les fluides réactifs, l'électrochimie et l'électromagnétisme.
Limites de la licence
Les binaires STAR-CCM+ sont installés sur nos serveurs, mais nous n'avons pas de licence pour utilisation générale; vous devez donc posséder votre propre licence. Vous pouvez acheter une licence POD (Power On Demand) directement de Siemens. Autrement, vous pouvez utiliser une licence locale hébergée par votre établissement pourvu que le pare-feu permette à la grappe où les tâches seront exécutées d'y accéder.
Utilisation de votre propre serveur de licence
Afin de configurer votre compte pour utiliser un serveur de licence, créez le fichier $HOME/.licenses/starccm.lic
comme suit :
SERVER IP ANY PORT
USE_SERVER
où IP
et PORT
sont remplacés par l'adresse IP et le port statique starccm est utilisé par le serveur.
Fichier pour une licence POD
Si vous disposez d'une licence POD de Siemens configurez le fichier de licence sur une grappe comme suit :
SERVER flex.cd-adapco.com ANY 1999
USE_SERVER
Soumettre des tâches en lot sur nos grappes
Sélectionnez l’un des modules disponibles, selon vos besoins :
starccm
pour le format double précision, soitmodule load starccm/19.04.007-R8
starccm-mixed
pour le format précision mixte, soitmodule load starccm-mixed/19.04.007
.
Quand vous soumettez des tâches sur une grappe pour la première fois, vous devrez configurer votre environnement pour l’utilisation de votre licence. Si vous utilisez le serveur CD-adapco qui vous permet de payer uniquement pour votre consommation, créez simplement un fichier ~/.licenses/starccm.lic
comme décrit ci-dessus dans Fichier pour une licence POD.
Par contre, si vous utilisez un serveur de licence interne, créez d'abord le fichier ~/.licenses/starccm.lic
et soumettez un billet d'assistance au soutien technique. Nous vous aiderons à coordonner les modifications ponctuelles du pare-feu réseau nécessaires pour y accéder. Si vous rencontrez toujours des problèmes pour faire fonctionner la licence, essayez de supprimer ou de renommer le fichier ~/.flexlmrc
car les chemins de recherche et/ou les paramètres précédents du serveur de licence peuvent y être stockés et entrer en conflit avec vos paramètres starccm.lic
actuels. Notez que les fichiers des versions précédentes peuvent avoir accumulé une quantité importante d'espace disque dans des répertoires cachés nommés .star-version_number
si vous avez exécuté de nombreuses tâches longues par le passé en utilisant des scripts slurm plus anciens ou si vous exécutez régulièrement starccm+ en mode graphique. Ceux-ci peuvent être supprimés périodiquement en exécutant soigneusement rm -ri ~/.starccm*
et en répondant oui à l'affichage de l'invite.
Sur Niagara, les nœuds de calcul configurent le système de fichiers $HOME
en lecture seule (read only). Il est donc important de définir la variable d'environnement $STARCCM_TMP
et de la diriger vers $SCRATCH
, ce qui est unique à la version de StarCCM+. Autrement, StarCCM+ tente de créer le répertoire dans $HOME
et se termine de façon anormale.
#!/bin/bash
#SBATCH --account=def-group # indiquez le nom du compte
#SBATCH --time=00-01:00 # indiquez la limite de temps (jj-hh:mm)
#SBATCH --nodes=1 # indiquez 1 ou plusieurs nœuds
#SBATCH --cpus-per-task=40 # demandez tous les cœurs par nœud
#SBATCH --mem=0 # demandez toute la mémoire par nœud
#SBATCH --ntasks-per-node=1 # ne pas modifier
#module load StdEnv/2020 # Versions < 18.06.006
module load StdEnv/2023
#module load starccm/18.06.006-R8
module load starccm-mixed/18.06.006
# chargez le module starccm/18.04.008-R8
module load starccm-mixed/18.04.008
<div class="mw-translate-fuzzy">
export LM_PROJECT='YOUR CD-ADAPCO PROJECT ID GOES HERE'
export CDLMD_LICENSE_FILE="1999@flex.cd-adapco.com"
</div>
# ------- no changes required below this line --------
slurm_hl2hl.py --format STAR-CCM+ > $SLURM_TMPDIR/machinefile
NCORE=$((SLURM_NNODES * SLURM_CPUS_PER_TASK * SLURM_NTASKS_PER_NODE))
if [ -n "$LM_PROJECT" ]; then
# Siemens PoD license server
starccm+ -jvmargs -Xmx4G -jvmargs -Djava.io.tmpdir=$SLURM_TMPDIR -batch -power -podkey $LM_PROJECT -np $NCORE -nbuserdir $SLURM_TMPDIR -machinefile $SLURM_TMPDIR/machinefile $JAVA_FILE $SIM_FILE
else
# Institutional license server
starccm+ -jvmargs -Xmx4G -jvmargs -Djava.io.tmpdir=$SLURM_TMPDIR -batch -np $NCORE -nbuserdir $SLURM_TMPDIR -machinefile $SLURM_TMPDIR/machinefile $JAVA_FILE $SIM_FILE
fi
#!/bin/bash
#SBATCH --account=def-group # Specify some account
#SBATCH --time=00-01:00 # Time limit: dd-hh:mm
#SBATCH --nodes=1 # Specify 1 or more nodes
#SBATCH --cpus-per-task=48 # Request all cores per node (32 or 48)
#SBATCH --mem=0 # Request all memory per node
#SBATCH --ntasks-per-node=1 # Do not change this value
#module load StdEnv/2020 # Versions < 18.06.006
module load StdEnv/2023
#module load starccm/18.06.006-R8
module load starccm-mixed/18.06.006
SIM_FILE='mysample.sim' # Specify your input sim filename
#JAVA_FILE='mymacros.java' # Uncomment to specify an input java filename
export STARCCM_TMP="${SCRATCH}/.starccm-${EBVERSIONSTARCCM}"
mkdir -p "$STARCCM_TMP"
slurm_hl2hl.py --format STAR-CCM+ > machinefile-$SLURM_JOB_ID
slurm_hl2hl.py --format STAR-CCM+ > $SLURM_TMPDIR/machinefile
NCORE=$((SLURM_NNODES * SLURM_CPUS_PER_TASK * SLURM_NTASKS_PER_NODE))
if [ -n "$LM_PROJECT" ]; then
# Siemens PoD license server
starccm+ -jvmargs -Xmx4G -jvmargs -Djava.io.tmpdir=$SLURM_TMPDIR -batch -power -podkey $LM_PROJECT -np $NCORE -nbuserdir $SLURM_TMPDIR -machinefile $SLURM_TMPDIR/machinefile $JAVA_FILE $SIM_FILE -mpi intel -fabric psm2
else
# Institutional license server
starccm+ -jvmargs -Xmx4G -jvmargs -Djava.io.tmpdir=$SLURM_TMPDIR -batch -np $NCORE -nbuserdir $SLURM_TMPDIR -machinefile $SLURM_TMPDIR/machinefile $JAVA_FILE $SIM_FILE -mpi intel -fabric psm2
fi
#!/bin/bash
#SBATCH --account=def-group # Specify some account
#SBATCH --time=00-01:00 # Time limit: dd-hh:mm
#SBATCH --nodes=1 # Specify 1 or more nodes
#SBATCH --cpus-per-task=32 # Request all cores per node (32 or 44)
#SBATCH --mem=0 # Request all memory per node
#SBATCH --ntasks-per-node=1 # Do not change this value
#module load StdEnv/2020 # Versions < 18.06.006
module load StdEnv/2023
#module load starccm/18.06.006-R8
module load starccm-mixed/18.06.006
SIM_FILE='mysample.sim' # Specify your input sim filename
#JAVA_FILE='mymacros.java' # Uncomment to specify an input java filename
export STARCCM_TMP="${SCRATCH}/.starccm-${EBVERSIONSTARCCM}"
mkdir -p "$STARCCM_TMP"
slurm_hl2hl.py --format STAR-CCM+ > machinefile-$SLURM_JOB_ID
slurm_hl2hl.py --format STAR-CCM+ > $SLURM_TMPDIR/machinefile
NCORE=$((SLURM_NNODES * SLURM_CPUS_PER_TASK * SLURM_NTASKS_PER_NODE))
if [ -n "$LM_PROJECT" ]; then
# Siemens PoD license server
starccm+ -jvmargs -Xmx4G -jvmargs -Djava.io.tmpdir=$SLURM_TMPDIR -batch -power -podkey $LM_PROJECT -np $NCORE -nbuserdir $SLURM_TMPDIR -machinefile $SLURM_TMPDIR/machinefile $JAVA_FILE $SIM_FILE -mpi intel -fabric psm2
else
# Institutional license server
starccm+ -jvmargs -Xmx4G -jvmargs -Djava.io.tmpdir=$SLURM_TMPDIR -batch -np $NCORE -nbuserdir $SLURM_TMPDIR -machinefile $SLURM_TMPDIR/machinefile $JAVA_FILE $SIM_FILE -mpi intel -fabric psm2
fi
#!/bin/bash
#SBATCH --account=def-group # indiquez le nom du compte
#SBATCH --time=00-01:00 # indiquez la limite de temps (jj-hh:mm)
#SBATCH --nodes=1 # indiquez 1 ou plusieurs nœuds
#SBATCH --cpus-per-task=64 # demandez tous les cœurs par nœud
#SBATCH --mem=0 # demandez toute la mémoire par nœud
#SBATCH --ntasks-per-node=1 # ne pas modifier
#module load StdEnv/2020 # Versions < 18.06.006
module load StdEnv/2023
#module load starccm/18.06.006-R8
module load starccm-mixed/18.06.006
SIM_FILE='mysample.sim' # Specify your input sim filename
#JAVA_FILE='mymacros.java' # Uncomment to specify an input java filename
<div class="mw-translate-fuzzy">
export STARCCM_TMP="${SCRATCH}/.starccm-${EBVERSIONSTARCCM}"
mkdir -p "$STARCCM_TMP"
</div>
# ------- no changes required below this line --------
<div class="mw-translate-fuzzy">
NCORE=$((SLURM_NNODES * SLURM_CPUS_PER_TASK * SLURM_NTASKS_PER_NODE))
</div>
<div class="mw-translate-fuzzy">
# supprimez <i>-power -podkey $LM_PROJECT</i> si vous utilisez un serveur de licence de votre établissement
starccm+ -jvmargs -Xmx4G -jvmargs -Djava.io.tmpdir=$SLURM_TMPDIR -batch -power -podkey $LM_PROJECT -np $NCORE -licpath $CDLMD_LICENSE_FILE -nbuserdir $SLURM_TMPDIR -machinefile $STARCCM_TMP/machinefile-$SLURM_JOB_ID $PWD/your-file.sim -mpi openmpi
</div>
<div class="mw-translate-fuzzy">
#SBATCH --account=def-group # indiquez le nom du compte
#SBATCH --time=00-01:00 # indiquez la limite de temps (jj-hh:mm)
#SBATCH --nodes=1 # indiquez 1 ou plusieurs nœuds
#SBATCH --cpus-per-task=40 # demandez tous les cœurs par nœud
#SBATCH --mem=0 # demandez toute la mémoire par nœud
#SBATCH --ntasks-per-node=1 # ne pas modifier
#SBATCH --mail-type=BEGIN
#SBATCH --mail-type=END
module load CCEnv
</div>
#module load StdEnv/2020 # Versions < 18.06.006
module load StdEnv/2023
#module load starccm/18.06.006-R8
module load starccm-mixed/18.06.006
SIM_FILE='mysample.sim' # Specify input sim filename
#JAVA_FILE='mymacros.java' # Uncomment to specify an input java filename
# Comment the next line when using an institutional license server
LM_PROJECT='my22digitpodkey' # Specify your Siemens Power on Demand (PoD) Key
# These settings are used instead of your ~/.licenses/starccm.lic
# (settings shown will use the cd-adapco pod license server)
FLEXPORT=1999 # Specify server static flex port
VENDPORT=2099 # Specify server static vendor port
LICSERVER=flex.cd-adapco.com # Specify license server hostname
# ------- no changes required below this line --------
export CDLMD_LICENSE_FILE="$FLEXPORT@127.0.0.1"
ssh nia-gw -L $FLEXPORT:$LICSERVER:$FLEXPORT -L $VENDPORT:$LICSERVER:$VENDPORT -N -f
slurm_hl2hl.py --format STAR-CCM+ > $SLURM_TMPDIR/machinefile
NCORE=$((SLURM_NNODES * SLURM_CPUS_PER_TASK * SLURM_NTASKS_PER_NODE))
# Workaround for license failures:
# until the exit status is equal to 0, we try to get Star-CCM+ to start (here, for at least 5 times).
i=1
RET=-1
while [ $i -le 5 ] && [ $RET -ne 0 ]; do
[ $i -eq 1 ] || sleep 5
echo "Attempt number: "$I
if [ -n "$LM_PROJECT" ]; then
# Siemens PoD license server
starccm+ -jvmargs -Xmx4G -jvmargs -Djava.io.tmpdir=$SLURM_TMPDIR -batch -power -podkey $LM_PROJECT -np $NCORE -nbuserdir $SLURM_TMPDIR -machinefile $SLURM_TMPDIR/machinefile $JAVA_FILE $SIM_FILE
else
# Institutional license server
starccm+ -jvmargs -Xmx4G -jvmargs -Djava.io.tmpdir=$SLURM_TMPDIR -batch -np $NCORE -nbuserdir $SLURM_TMPDIR -machinefile $SLURM_TMPDIR/machinefile $JAVA_FILE $SIM_FILE
fi
RET=$?
i=$((i+1))
done
exit $RET
Visualisation à distance
Préparation
Configurez votre compte pour visualiser à distance :
- Créez le fichier de licence
~/.licenses/starccm.lic
comme décrit ci-dessus. - Si vous avez une licence POD (Power-on-demand),
- configurez
export LM_PROJECT='CD-ADAPCO PROJECT ID'
et - ajoutez -power aux autres options ligne de commande, comme montré ci-dessous.
- configurez
Nœuds de calcul
Connectez-vous à un nœud avec TigerVNC et ouvrez une fenêtre de terminal, puis
- STAR-CCM+ 15.04.010 (ou versions plus récentes)
module load StdEnv/2020
module load starccm-mixed/17.02.007
**OU**starccm/16.04.007-R8
- starccm+
- STAR-CCM+ 14.06.010, 14.04.013, 14.02.012
module load StdEnv/2016
module load starccm-mixed/14.06.010
**OU**starccm/14.06.010-R8
- starccm+
- STAR-CCM+ 13.06.012 (ou versions moins récentes)
module load StdEnv/2016
module load starccm-mixed/13.06.012
**OU**starccm/13.06.012-R8
- starccm+ -mesa
Nœuds VDI
Connectez-vous à gra-vdi avec TigerVNC et connectez-vous. Quand le bureau distant est affiché, cliquez sur
ouvrez une fenêtre de terminal (Applications-->Systems Tools-->Mate Terminal) pour ouvrir une fenêtre de terminal et indiquez la version de Star-CCM que vous voulez charger (voir ci-dessous). Si vous avez déjà chargé un StdEnv, vous pouvez faire afficher les versions disponibles avec la commande module avail starccm-mixed
. Présentement, seulement l'implémentation MESA de OpenGL peut être utilisée sur gra-vdi avec starccm en raison de problèmes avec virtualgl qui offre l'accélération des GPU locaux pour les graphiques OpenGL.
- STAR-CCM+ 18.04.008 (ou versions plus récentes)
module load CcEnv StdEnv/2023
module load starccm-mixed/18.04.008
**OR**starccm/18.04.008-R8
- starccm+ -mesa
- STAR-CCM+ 15.04.010 --> 18.02.008 (de version X jusqu'à version Y)
module load CcEnv StdEnv/2020
module load starccm-mixed/15.04.010
**OR**starccm/15.04.010-R8
- starccm+ -mesa
- STAR-CCM+ 13.06.012 (ou versions moins récentes)
module load CcEnv StdEnv/2016
module load starccm-mixed/13.06.012
**OR**starccm/13.06.012-R8
- starccm+ -mesa