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Pour certains paquets complexes (par exemple MATLAB), il est parfois utile de démarrer à distance l'interface utilisateur graphique. Pour ce faire, on utilise généralement SSH avec redirection X11, mais la performance est souvent trop lente, tout comme avec MobaXTerm ou Putty. Une meilleure option est d'utiliser VNC pour se connecter à un ordinateur à distance.