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* [[LAMMPS]] | * [[LAMMPS]] | ||
* [https://openkim.org/ OpenKIM] (''Knowledgebase of Interatomic Models'') | * [https://openkim.org/ OpenKIM] (''Knowledgebase of Interatomic Models'') | ||
* [ | * [[OpenMM/fr|OpenMM]] | ||
* [https://www.plumed.org PLUMED], bibliothèque de code pour le développement relatif au calcul de l'énergie libre dans les simulations en dynamique moléculaire (voir aussi [[GROMACS/fr|GROMACS]]) | * [https://www.plumed.org PLUMED], bibliothèque de code pour le développement relatif au calcul de l'énergie libre dans les simulations en dynamique moléculaire (voir aussi [[GROMACS/fr|GROMACS]]) | ||
* [https://www.rosettacommons.org Rosetta] | * [https://www.rosettacommons.org Rosetta] | ||
* [https://swift.cmbi.umcn.nl/gv/dssp/ DSSP] | * [https://swift.cmbi.umcn.nl/gv/dssp/ DSSP] | ||
* [[VMD/fr|VMD]] | * [[VMD/fr|VMD]] | ||