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Using GPUs with Slurm/fr: Difference between revisions
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Le tableau suivant décrit les nœuds avec GPUs présentement disponibles avec [[Cedar/fr|Cedar]] et [[Graham/fr|Graham]]. | Le tableau suivant décrit les nœuds avec GPUs présentement disponibles avec [[Cedar/fr|Cedar]] et [[Graham/fr|Graham]]. | ||
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| 160 || ''GPU base'', Graham || 32|| 128Go || 2 || NVIDIA P100-PCIE-12GB || un GPU par socket CPU | | 160 || ''GPU base'', Graham || 32|| 128Go || 2 || NVIDIA P100-PCIE-12GB || un GPU par socket CPU | ||
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== Tâches avec un seul cœur == | == Tâches avec un seul cœur == | ||
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=== Ordonnancement d'un nœud ''GPU large'' pour Cedar === | === Ordonnancement d'un nœud ''GPU large'' pour Cedar === | ||
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Sur la grappe [[Cedar/fr|Cedar]] se trouve des nœuds de type ''GPU large'' qui ont chacun quatre cartes Tesla P100 16Go; les autres nœuds sont de 12Go. Les GPUs du groupe spécial utilisent le all use the same PCI switch so the inter-GPU communication latency is lower, but bandwidth between CPU and GPU is lower than on the regular GPU nodes. The nodes also have 256 GB RAM instead of 128GB. In order to use these nodes you must specify <code>lgpu</code>. By-gpu requests can '''only run up to 24 hours'''. | Sur la grappe [[Cedar/fr|Cedar]] se trouve des nœuds de type ''GPU large'' qui ont chacun quatre cartes Tesla P100 16Go; les autres nœuds sont de 12Go. Les GPUs du groupe spécial utilisent le all use the same PCI switch so the inter-GPU communication latency is lower, but bandwidth between CPU and GPU is lower than on the regular GPU nodes. The nodes also have 256 GB RAM instead of 128GB. In order to use these nodes you must specify <code>lgpu</code>. By-gpu requests can '''only run up to 24 hours'''. | ||
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{{File | {{File | ||
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===Regroupement de tâches pour un seul GPU=== | ===Regroupement de tâches pour un seul GPU=== | ||
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If user needs to run 4 x single GPU codes or 2 x 2-GPU codes in a node for '''longer than 24 hours''', [https://www.gnu.org/software/parallel/ GNU Parallel] is recommended. A simple example is given below: | If user needs to run 4 x single GPU codes or 2 x 2-GPU codes in a node for '''longer than 24 hours''', [https://www.gnu.org/software/parallel/ GNU Parallel] is recommended. A simple example is given below: | ||
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GPU id will be calculated by slot id {%} minus 1. {#} is the job id, starting from 1. | GPU id will be calculated by slot id {%} minus 1. {#} is the job id, starting from 1. | ||
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A params.input file should include input parameters in each line like: | A params.input file should include input parameters in each line like: | ||