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* [http://nglviewer.org/ nglview], collection d'outils en ligne pour la visualisation en moléculaire. | * [http://nglviewer.org/ nglview], collection d'outils en ligne pour la visualisation en moléculaire. | ||
* [http://parmed.github.io/ParmEd/ ParmEd], outil général pour l'analyse des systèmes biomoléculaires avec des paquets de simulation populaires. | * [http://parmed.github.io/ParmEd/ ParmEd], outil général pour l'analyse des systèmes biomoléculaires avec des paquets de simulation populaires. | ||
* [ | * [[PyRETIS]], bibliothèque Python pour les simulations d'événements rares, avec une emphase sur l'échantillonage d'interfaces de transition et d'interfaces de transition avec échange de réplication. | ||