HPC4Health/fr: Difference between revisions

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Dans le cadre des concours de 2020, il y aura un projet pilote pour l’allocation de ressources sur une grappe fournie par HPC4Health.
Dans le cadre des concours de 2020, il y aura un projet pilote pour l’allocation de ressources sur une grappe fournie par HPC4Health.


HPC4Health is a consortium of health providers from the University Health Network and The Hospital for Sick Children who build and maintain a virtualized compute infrastructure with high levels of security for health-related computation.   
HPC4Health est un consortium de services de santé du University Health Network et du centre hospitalier The Hospital for Sick Children de Toronto. L'organisation construit et maintient une infrastructure virtuelle de calcul avec de hauts niveaux de sécurité.   


Le service sera configuré selon les standards de Calcul Canada (Slurm, CVMFS); sur demande, des configurations techniques particulières pourraient être considérées. La disponibilité et le soutien ne sont pas encore pleinement déterminés; ils pourraient être modifiés au courant de l’année d’allocation, mais la plateforme devrait recevoir le même soutien que les autres sites hôtes.
Le service sera configuré selon les standards de Calcul Canada (Slurm, CVMFS); sur demande, des configurations techniques particulières pourraient être considérées. La disponibilité et le soutien ne sont pas encore pleinement déterminés; ils pourraient être modifiés au courant de l’année d’allocation, mais la plateforme devrait recevoir le même soutien que les autres sites hôtes.
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<big>'''''Admissibilité'''''</big>  
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Pre-consultation with HPC4Health is required in order for an allocation request to be considered. Contact [mailto:rac@computecanada.ca rac@computecanada.ca] to arrange a consultation.
Pour qu’une demande soit considérée, il faut d’abord obtenir une consultation avec HPC4Health; pour ce faire, contactez [mailto:rac@computecanada.ca rac@calculcanada.ca].
 
Les conditions d'admissibilité sont :
* de signer une entente de collaboration avec le University Health Network;
* de ne pas servir de réseau d’information sur la santé conformément à la ''Loi sur la protection des renseignements personnels sur la santé'' (LPRPS), c’est-à-dire, de ne pas utiliser les services pour partager les données avec des collaborateurs ou sur le web;
* d'utiliser une double authentification pour se connecter aux services.


In order to be eligible for HPC4Health resources, RAC awardees will be required to:
Avant que l’allocation ne soit implémentée, les utilisateurs devront rencontrer l'équipe de HPC4Health pour signer l'entente de collaboration et confirmer qu'ils ne sont pas fournisseurs de services de santé.  
#  Sign a collaboration agreement with the University Health Network
# Not act as a health information network provider under PHIPA (i.e., not to use HPC4Health resources to share the data to collaborators or through the web)
# Use two factor authentication to log into the services  
Once awarded, recipients of the HPC4Health RAC resources will require consultation with the HPC4Health team to coordinate signing of the collaboration agreement and confirmation that recipients will not act as health information network providers.  


Eligible projects for HPC4Health resources will be health-related.  Health research computation includes data sets which may otherwise be restricted to local institution compute systems due to it containing PHI, de-identified but still sensitive data, or data which cannot be easily deidentified (e.g. whole genomes). HPC4Health will work with end users and their institutional REB and Legal departments to ensure any specific requirements can be met.
Les projets admissibles sont dans le domaine de la santé où les données utilisées en recherche incluent des ensembles de données confidentielles dont l’utilisation est réservée au système informatique de chaque établissement; des données anonymes, mais sensibles; ou des données qui sont difficilement anonymisées (par exemple, les séquences complètes des génomes). HPC4Health collaborera avec les utilisateurs, les comités d’éthique de la recherche et les services juridiques pour que les besoins spécifiques soient comblés.
   
   




<big>'''''Infrastructure For RAC 2020'''''</big>  
<big>'''''Infrastructure disponible pour les concours de 2020'''''</big>  


HPC4Health is allocating 500 CPU cores and 60TB of storage to the RAC pilot project.  
HPC4Health rendra disponibles 500 cœurs CPU et 60To d'espace de stockage.  


Compute node specifications:  
Caractéristiques des nœuds de calcul :  


* 7 compute nodes with 38 cores and 230GB RAM
* 7 nœuds de calcul avec 38 cœurs et mémoire vive de 230Go


* 7 compute nodes with 38 cores and 125GB RAM
* 7 nœuds de calcul avec 38 cœurs et mémoire vive de 125Go


* 10 GE interconnects
* 10 interconnexions GE


* 60TB of scale-out NFS accessible storage
* 60To d'espace évolutif de stockage NFS (''network file system'')




HPC4Health does not provide clients with tape backups, backups are the responsibility of the user.
Il revient aux utilisateurs de faire leurs propres copies de sauvegarde; ce service (sauvegarde sur bandes) n'est pas fourni par HPC4Health.

Latest revision as of 21:11, 25 September 2020


Outdated

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Other languages:

Contexte

Dans le cadre des concours de 2020, il y aura un projet pilote pour l’allocation de ressources sur une grappe fournie par HPC4Health.

HPC4Health est un consortium de services de santé du University Health Network et du centre hospitalier The Hospital for Sick Children de Toronto. L'organisation construit et maintient une infrastructure virtuelle de calcul avec de hauts niveaux de sécurité.

Le service sera configuré selon les standards de Calcul Canada (Slurm, CVMFS); sur demande, des configurations techniques particulières pourraient être considérées. La disponibilité et le soutien ne sont pas encore pleinement déterminés; ils pourraient être modifiés au courant de l’année d’allocation, mais la plateforme devrait recevoir le même soutien que les autres sites hôtes.


Admissibilité

Pour qu’une demande soit considérée, il faut d’abord obtenir une consultation avec HPC4Health; pour ce faire, contactez rac@calculcanada.ca.

Les conditions d'admissibilité sont :

  • de signer une entente de collaboration avec le University Health Network;
  • de ne pas servir de réseau d’information sur la santé conformément à la Loi sur la protection des renseignements personnels sur la santé (LPRPS), c’est-à-dire, de ne pas utiliser les services pour partager les données avec des collaborateurs ou sur le web;
  • d'utiliser une double authentification pour se connecter aux services.

Avant que l’allocation ne soit implémentée, les utilisateurs devront rencontrer l'équipe de HPC4Health pour signer l'entente de collaboration et confirmer qu'ils ne sont pas fournisseurs de services de santé.

Les projets admissibles sont dans le domaine de la santé où les données utilisées en recherche incluent des ensembles de données confidentielles dont l’utilisation est réservée au système informatique de chaque établissement; des données anonymes, mais sensibles; ou des données qui sont difficilement anonymisées (par exemple, les séquences complètes des génomes). HPC4Health collaborera avec les utilisateurs, les comités d’éthique de la recherche et les services juridiques pour que les besoins spécifiques soient comblés.


Infrastructure disponible pour les concours de 2020

HPC4Health rendra disponibles 500 cœurs CPU et 60To d'espace de stockage.

Caractéristiques des nœuds de calcul :

  • 7 nœuds de calcul avec 38 cœurs et mémoire vive de 230Go
  • 7 nœuds de calcul avec 38 cœurs et mémoire vive de 125Go
  • 10 interconnexions GE
  • 60To d'espace évolutif de stockage NFS (network file system)


Il revient aux utilisateurs de faire leurs propres copies de sauvegarde; ce service (sauvegarde sur bandes) n'est pas fourni par HPC4Health.