Hélios/en: Difference between revisions

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{| class="wikitable"
{{Warning|title=Retirement of Helios|content=Helios has been decommissionned.}}
|-
| Availability: March 2014
|-
| Nœud frontal : '''helios3.calculquebec.ca'''
|-
| Point de chute Globus : '''computecanada#helios-dtn'''
|-
| Nœud de copie (rsync, scp, sftp,...) : '''helios3.calculquebec.ca'''
|}


Hélios est un superordinateur composé de nœuds à processeurs graphiques (GPGPU) qui a été installé dans le centre de calcul à l'université Laval au printemps 2014. Le serveur a été acheté à partir de fonds combinés de chercheurs de l'Université Laval, de l'Université de Montréal, ainsi qu'à partir de fonds de Calcul Québec. Jusqu'au déploiement de [[Cedar]] et [[Graham]], Hélios était le plus grand déploiement de GPGPU administré par Calcul Canada, à la fois en terme de nombre de GPU et de puissance de calcul.
Hélios was a supercomputer with general purpose graphics processor nodes (GPGPU). It was installed in Laval University's computing centre in the spring of 2014. In prevision for its decommissionning, interactive access through SSH was blocked on October 26th, 2022. Data can still be retrieved via Globus.
 
= Transférer vos données =
En date de janvier 2020, Hélios est en train d'être migré afin d'être uniformisé avec les nouveaux standards de Calcul Canada. Cela signifige :
* Une migration des identifiants de connexion de Calcul Québec vers ceux de Calcul Canada
* Une migration de l'ordonnanceur Moab vers l'ordonnanceur Slurm
* Une réorganisation des systèmes de fichiers afin de correspondre à la structure utilisée sur les autres grappes nationales
* Une mise à jour des logiciels et du système de modules
 
Pour cette migration, '''vous devrez transférer vos fichiers de l'ancien système de fichiers vers le nouveau'''. Pour ce faire, nous vous suggérons d'utiliser [[Globus]] entre les points de chute '''computecanada#colosse''' vers '''computecanada#helios-dtn'''.
 
=Particularités=
Notre politique veut que les nœuds de calcul de Hélios n'aient pas accès à l'internet. Pour y faire exception, contactez le [[Technical_support/fr|soutien technique]] en expliquant ce dont vous avez besoin et pourquoi. Notez que l'outil <code>crontab</code> n'est pas offert.
 
Chaque tâche devrait être d'une durée d’au moins une heure (au moins cinq minutes pour les tâches de test) et un utilisateur ne peut avoir plus de 1000 tâches (en exécution et en attente) à la fois. La durée maximale d'une tâche est 7 jours (168 heures).
 
== Sauvegardes ==
Contrairement aux nouvelles grappes nationales, '''il n'y a pas de sauvegarde''' des systèmes de fichiers d'Hélios. Vous devez donc conserver vos propres copies en lieu sûr.
 
== Jupyter ==
En plus de l'interface d'accès traditionnelle via SSH, Hélios propose une interface JupyterHub pour accéder à l'infrastructure. Pour y accéder, connectez-vous via l'adresse [https://jupyterhub.helios.calculquebec.ca/hub/spawn https://jupyterhub.helios.calculquebec.ca/hub/spawn].
 
== Environnement logiciel ==
Hélios utilise la version AVX de l'environnement logiciel de Calcul Canada. Vous pouvez trouver la liste des logiciels disponibles sous l'onglet AVX de la page [[Available software/fr|Logiciels disponibles]].
 
== GPUs disponibles ==
Hélios possède deux types de GPUs : NVIDIA K20 et NVIDIA K80. Pour spécifier l'un ou l'autre des deux types, utilisez les options suivantes dans votre script de soumission :
 
  #SBATCH --gres=gpu:k20:1
 
ou
 
  #SBATCH --gres=gpu:k80:1
 
=Stockage=
Hélios a un seul système de fichiers Lustre de 392To. Celui-ci est cependant divisé en trois espaces avec des quotas distincts, tel que sur les nouvelles grappes de calcul de Calcul Canada. Il n'y a aucune sauvegarde du système de fichiers.
 
{| class="wikitable sortable"
|-
| HOME <br> Système de fichiers Lustre ||
*Cet espace est petit et ne peut pas être agrandi : vous devrez utiliser votre espace <code>project</code> pour les grands besoins en stockage.
*50 Go d’espace et 500K fichiers par utilisateur.
|-
| SCRATCH <br> Système de fichiers Lustre ||
* Grand espace pour stocker les fichiers temporaires pendant les calculs.
* 20 To d’espace et 1M fichiers par utilisateur.
|-
| PROJECT <br> Système de fichiers Lustre ||
*Cet espace est conçu pour le partage de données entre membres d'un groupe et pour le stockage de beaucoup de données.
*1 To d’espace et 500K fichiers par groupe.
|}
 
Pour les transferts de données par Globus, on devrait utiliser le point de chute <code>computecanada#helios-dtn</code>, alors que pour les outils comme rsync et scp, on peut utiliser un nœud
de connexion.
 
=Caractéristiques des nœuds=
{| class="wikitable sortable"
! nœuds !! cœurs !! mémoire disponible !! CPU !! stockage !! GPU
|-
| 15 || 20 || 110G || 2 x Intel Xeon Ivy Bridge E5-2670 v2 @ 2.5 GHz || 1 x HDD de 2T || 8 x NVidia K20 (mémoire 5G)
|-
| 8 || 24 || 256G || 2 x Intel Xeon Ivy Bridge E5-2697 v2 @ 2.7 GHz || 2 x SSD de 180G (330G utilisable) || 8 x NVidia K80 (16 GPUs, mémoire de 12G/GPU)
|}

Latest revision as of 23:00, 29 August 2024

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Retirement of Helios

Helios has been decommissionned.



Hélios was a supercomputer with general purpose graphics processor nodes (GPGPU). It was installed in Laval University's computing centre in the spring of 2014. In prevision for its decommissionning, interactive access through SSH was blocked on October 26th, 2022. Data can still be retrieved via Globus.

Globus is a file transfer service

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