Hélios/en: Difference between revisions

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{| class="wikitable"
{{Warning|title=Retirement of Helios|content=Helios has been decommissionned.}}
|-
| Availability: March 2014
|-
| Login node: '''helios3.calculquebec.ca'''
|-
| Globus endpoint: '''computecanada#helios-dtn'''
|-
| Data transfer node (rsync, scp, sftp,...): '''helios3.calculquebec.ca'''
|}


Hélios is a supercomputer with general purpose graphics processor nodes (GPGPU) that was installed in Université Laval's computing centre in the spring of 2014. The server was purchased with funds from researchers at Laval and Montreal universities, as well as funds from Calcul Québec. Until the commissioning of [[Cedar]] and [[Graham]], Helios had been the largest GPU deployment administered by Compute Canada, both in terms of computing power and number of GPUs.
Hélios was a supercomputer with general purpose graphics processor nodes (GPGPU). It was installed in Laval University's computing centre in the spring of 2014. In prevision for its decommissionning, interactive access through SSH was blocked on October 26th, 2022. Data can still be retrieved via Globus.
 
= Transferring your data =
As of January 2020, Hélios is migrating to the new Compute Canada standards.
* Connection identifiers are migrated from Calcul Québec to Compute Canada;
* Scheduling is migrated from Moab to Slurm;
* Filesystems are reorganised to conform to the structure used on the other national clusters;
* The modules system and the software are updated.
 
In this context, '''you must transfer your files from the old to the new filesystem'''. We suggest you use [[Globus]] from endpoint '''computecanada#colosse''' to endpoint '''computecanada#helios-dtn'''.
 
=Particularités=
Notre politique veut que les nœuds de calcul de Hélios n'aient pas accès à l'internet. Pour y faire exception, contactez le [[Technical_support/fr|soutien technique]] en expliquant ce dont vous avez besoin et pourquoi. Notez que l'outil <code>crontab</code> n'est pas offert.
 
Chaque tâche devrait être d'une durée d’au moins une heure (au moins cinq minutes pour les tâches de test) et un utilisateur ne peut avoir plus de 1000 tâches (en exécution et en attente) à la fois. La durée maximale d'une tâche est 7 jours (168 heures).
 
== Backups ==
A difference between Hélios and the new national clusters is that '''Hélios filesystems are not backed up'''. Please make sure your files are safely backed up elsewhere.
 
== Jupyter ==
In addition to the traditional SSH access interface, you can also use a JupyterHub interface by connecting through [https://jupyterhub.helios.calculquebec.ca/hub/spawn https://jupyterhub.helios.calculquebec.ca/hub/spawn].
 
== Environnement logiciel ==
Hélios utilise la version AVX de l'environnement logiciel de Calcul Canada. Vous pouvez trouver la liste des logiciels disponibles sous l'onglet AVX de la page [[Available software/fr|Logiciels disponibles]].
 
== GPUs disponibles ==
Hélios possède deux types de GPUs : NVIDIA K20 et NVIDIA K80. Pour spécifier l'un ou l'autre des deux types, utilisez les options suivantes dans votre script de soumission :
 
  #SBATCH --gres=gpu:k20:1
 
or
 
  #SBATCH --gres=gpu:k80:1
 
=Stockage=
Hélios a un seul système de fichiers Lustre de 392To. Celui-ci est cependant divisé en trois espaces avec des quotas distincts, tel que sur les nouvelles grappes de calcul de Calcul Canada. Il n'y a aucune sauvegarde du système de fichiers.
 
{| class="wikitable sortable"
|-
| HOME <br> Système de fichiers Lustre ||
*Cet espace est petit et ne peut pas être agrandi : vous devrez utiliser votre espace <code>project</code> pour les grands besoins en stockage.
*50 Go d’espace et 500K fichiers par utilisateur.
|-
| SCRATCH <br> Système de fichiers Lustre ||
* Grand espace pour stocker les fichiers temporaires pendant les calculs.
* 20 To d’espace et 1M fichiers par utilisateur.
|-
| PROJECT <br> Système de fichiers Lustre ||
*Cet espace est conçu pour le partage de données entre membres d'un groupe et pour le stockage de beaucoup de données.
*1 To d’espace et 500K fichiers par groupe.
|}
 
Pour les transferts de données par Globus, on devrait utiliser le point de chute <code>computecanada#helios-dtn</code>, alors que pour les outils comme rsync et scp, on peut utiliser un nœud
de connexion.
 
=Caractéristiques des nœuds=
{| class="wikitable sortable"
! nœuds !! cœurs !! mémoire disponible !! CPU !! stockage !! GPU
|-
| 15 || 20 || 110G || 2 x Intel Xeon Ivy Bridge E5-2670 v2 @ 2.5 GHz || 1 x HDD de 2T || 8 x NVidia K20 (mémoire 5G)
|-
| 8 || 24 || 256G || 2 x Intel Xeon Ivy Bridge E5-2697 v2 @ 2.7 GHz || 2 x SSD de 180G (330G utilisable) || 8 x NVidia K80 (16 GPUs, mémoire de 12G/GPU)
|}

Latest revision as of 23:00, 29 August 2024

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Retirement of Helios

Helios has been decommissionned.



Hélios was a supercomputer with general purpose graphics processor nodes (GPGPU). It was installed in Laval University's computing centre in the spring of 2014. In prevision for its decommissionning, interactive access through SSH was blocked on October 26th, 2022. Data can still be retrieved via Globus.

Globus is a file transfer service

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