Revision as of 17:57, 5 October 2021

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Un moteur de recherche intelligent pour les environnements modulaires.

Mii works around an existing modules installation, efficiently searching and loading modules on-demand for users.

Une fois Mii chargé, les modules sont chargés automatiquement dans le cas de commandes non ambigues. Pour les commandes ambigues, Mii demande interactivement si les modules doivent être chargés

Caractéristiques :

prend en charge les installations de Lmod et Environment Modules
intégration des interpréteurs bash et zsh
liste des modules / renseignements particuliers (via mii list, mii show)
recherche de commande exactes (via mii exact)
recherche de commandes similaires (via mii search)
format d'exportation JSON optionnel

Important note

A module that is autoloaded does not persist after the command. The shell environment will be the same as it was before mii autoloaded a module.

Activation

Chargez et activez avec la commande

[name@server ~]$ module load mii

Une fois chargé, Mii émet des suggestions. Par exemple, si une commande est introuvable, Mii suggère

[name@server ~]$ cmd
[mii] cmd not found! Similar commands: "cmp", "cmp", "dcmd"

Commandes non ambigües

Une commande ou un binaire qui est connu et non ambigu sera chargé automatiquement.

[name@server ~]$ python3.9 --version
[mii] loading StdEnv/2020 python/3.9.6 ...
Python 3.9.6

Commandes ambigües

Si une commande ou un binaire n'est pas connu ou est ambigu, Mii suggère des candidats potentiels en se basant sur leur pertinence.

[name@server ~]$ blastn -version
[mii] Please select a module to run blastn:
       MODULE         PARENT(S)
    1  blast+/2.12.0  StdEnv/2020 gcc/9.3.0
    2  blast+/2.11.0  StdEnv/2020 gcc/9.3.0
    3  blast+/2.10.1  StdEnv/2020 gcc/9.3.0
    4  rmblast/2.10.0 StdEnv/2020 gcc/9.3.0
    5  blast+/2.10.1  nixpkgs/16.09 gcc/7.3.0
    6  blast+/2.10.0  nixpkgs/16.09 gcc/7.3.0
    7  blast+/2.9.0   nixpkgs/16.09 gcc/7.3.0
    8  blast+/2.8.1   nixpkgs/16.09 gcc/7.3.0
    9  blast+/2.7.1   nixpkgs/16.09 gcc/7.3.0
    10 blast+/2.4.0   nixpkgs/16.09 gcc/7.3.0
    11 igblast/1.9.0  nixpkgs/16.09 gcc/7.3.0
    12 rmblast/2.9.0  nixpkgs/16.09 gcc/7.3.0
    13 blast+/2.6.0   nixpkgs/16.09 gcc/5.4.0
    14 igblast/1.9.0  nixpkgs/16.09 gcc/5.4.0
    15 igblast/1.8.0  nixpkgs/16.09 gcc/5.4.0
    16 igblast/1.7.0  nixpkgs/16.09 gcc/5.4.0
    17 rmblast/2.6.0  nixpkgs/16.09 gcc/5.4.0
    18 igblast/1.8.0  nixpkgs/16.09 gcc/4.8.5
Make a selection (1-18, q aborts) [1]: 1
[mii] loading StdEnv/2020 gcc/9.3.0 blast+/2.12.0 ...

Lmod is automatically replacing "intel/2020.1.217" with "gcc/9.3.0".


Due to MODULEPATH changes, the following have been reloaded:
  1) openmpi/4.0.3

blastn: 2.12.0+
 Package: blast 2.12.0, build Sep 27 2021 15:23:34

Dans cet exemple, nous avons entré le chiffre 1 à l'invite Make a selection et la commande s'est exécutée.

Recherche

Vous pouvez chercher des binaires pour obtenir la liste des modules qui les offrent. Les résultats sont présenté dans l'ordre de leur pertinence.

[name@server ~]$ mii search pgc+
Results for "pgc+": (total 16)
    MODULE            COMMAND      PARENT(S)        RELEVANCE
    nvhpc/20.7        pgcc         StdEnv/2020      high
    nvhpc/20.7        pgc++        StdEnv/2020      high
    pgi/19.4          pgcc         nixpkgs/16.09    high
    pgi/19.4          pgc++        nixpkgs/16.09    high
    pgi/17.3          pgc          nixpkgs/16.09    high
    pgi/17.3          pgcc         nixpkgs/16.09    high
    pgi/17.3          pgc++        nixpkgs/16.09    high
    pgi/16.9          pgc          nixpkgs/16.09    high
    pgi/16.9          pgcc         nixpkgs/16.09    high
    pgi/16.9          pgc++        nixpkgs/16.09    high
    pgi/13.10         pgc          nixpkgs/16.09    high
    pgi/13.10         pgcc         nixpkgs/16.09    high
    pgi/13.10         pgc++        nixpkgs/16.09    high
    pgi/13.10         pgCC         nixpkgs/16.09    high
    gcccore/.9.3.0    gcc          StdEnv/2020      medium
    gcccore/.9.3.0    g++          StdEnv/2020      medium

Désactiver Mii

Lancez la commande

[name@server ~]$ mii disable

Réactiver Mii