SQLite/fr

SQLite est un système de gestion de bases de données pour construire des BD dites de poche, car elles offrent toutes les fonctionnalités des BD relationnelles sans l'architecture client-serveur, avec en plus l'avantage que toutes les données résident sur un seul fichier disque qui peut simplement être copié sur un autre ordinateur. Des applications écrites dans plusieurs langages bien connus peuvent lire et écrire dans un fichier SQLite par des requêtes SQL standard via leur API d'interaction avec les BD.

Les bases de données SQLite, comme toutes les autres, ne devraient pas être utilisées dans des systèmes de fichiers partagés comme /home, /scratch et /project. Au début d'une tâche, vous devriez en principe copier le fichier SQLite sur l'espace local /scratch $SLURM_TMPDIR où vous pourrez utiliser la base de données sans problème tout en bénéficiant de la meilleure performance. Notez que SQLite ne prévoit pas l'emploi de plusieurs fils ou processus qui écrivent dans la base de données en même temps; pour ce faire, vous devriez utiliser une solution client-serveur.

Utiliser SQLite directement

Vous pouvez aussi accéder directement à une base de données SQLite en utilisant le client natif.

[name@server ~]$ sqlite3 foo.sqlite

Si le fichier foo.sqlite n'existe pas, SQLite le crée et ce client démarre dans une base de données vide, autrement, vous êtes connecté à la base de données existante. Vous pouvez alors exécuter toutes les requêtes, par exemple lancer SELECT * FROM tablename; pour faire afficher à l'écran le contenu de tablename.

Accéder à SQLite à partir d'un programme

Le moyen le plus habituel d'interagir avec une BD SQLite (ou toute autre) est d'utiliser des appels de fonctions pour établir la connexion; exécuter les requêtes de lecture, d'écriture ou de mise à jour des données; et fermer la connexion pour que les modifications soient reflétées dans le fichier disque SQLite.

PythonRC++

#!/usr/bin/env python3

# For Python we can use the module sqlite3, installed in a virtual environment, 
# to access an SQLite database
import sqlite3

age = 34

# Connect to the database...
dbase = sqlite3.connect("foo.sqlite")

dbase.execute("INSERT INTO employee(name,age) VALUES(\"John Smith\"," + str(age) + ");")

# Close the database connection
dbase.close()

# Using R, the first step is to install the RSQLite package in your R environment, 
# after which you can use code like the following to interact with the SQLite database
library(DBI)

age <- 34

# Connect to the database...
dbase <- dbConnect(RSQLite::SQLite(),"foo.sqlite")

# A parameterized query
query <- paste(c("INSERT INTO employee(name,age) VALUES(\"John Smith\",",toString(age),");"),collapse='')
dbExecute(dbase,query)

# Close the database connection
dbDisconnect(dbase)

#include <iostream>
#include <string>
#include <sqlite3.h>

int main(int argc,char** argv)
{
  int age = 34;
  std::string query;
  sqlite3* dbase;

  sqlite3_open("foo.sqlite",&dbase);

  query = "INSERT INTO employee(name,age) VALUES(\"John Smith\"," + std::to_string(age) + ");";
  sqlite3_exec(dbase,query.c_str(),nullptr,nullptr,nullptr);

  sqlite3_close(dbase);

  return 0;
}

Caveats

SQLite is as the name suggests easy to use and intended for relatively simple databases and which are neither excessively large (hundreds of gigabytes or more) nor too complicated in terms of their entity-relationship diagram. As your SQLite database grows in size and complexity the performance could start to degrade, in which case the time may have come to consider the use of more sophisticated database software which uses a client/server model. The SQLite web site includes an excellent page on Appropriate Uses For SQLite, including a checklist for choosing between SQLite and client/server databases.