Translations:Biomolecular simulation/13/fr

• MDAnalysis, une bibliothèque Python orientée objet pour l'analyse de trajectoires dans les simulations de dynamique moléculaires (MD) dans plusieurs formats populaires.
• MDTraj, qui peut aussi lire, écrire et analyser des trajectoires par quelques lignes de code Python, dans une grande variété de formats.
• Biopython, un ensemble d'outils gratuits pour les calculs biologiques.
• foyer, un paquet pour déterminer le type des atomes et appliquer et disséminer les champs de force.
• mBuild, un langage hiérarchique pour construire des molécules basé sur des composantes.
• mdsynthesis, un moteur de persistance pour les données en mécanique moléculaire.
• nglview, une collection d'outils en ligne pour les graphiques moléculaires.
• ParmEd, un outil général pour les investigations de systèmes biomoléculaires avec des paquets de simulation populaires.
• PyRETIS, une bibliothèque Python pour les simulations d'événements rares, avec une emphase sur l'échantillonage d'interfaces de transition et d'interfaces de transition avec échange de réplication.