Translations:Biomolecular simulation/13/fr
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- MDAnalysis, bibliothèque Python orientée objet pour l'analyse de trajectoires dans les simulations de dynamique moléculaires dans plusieurs formats.
- MDTraj, qui peut aussi lire, écrire et analyser des trajectoires par quelques lignes de code Python, dans une grande variété de formats.
- Biopython, ensemble d'outils gratuits pour les calculs biologiques.
- foyer, paquet pour déterminer le type des atomes et appliquer et disséminer les champs de force.
- mBuild, langage hiérarchique pour construire des molécules basées sur des composantes.
- mdsynthesis, ensemble d’outils de manipulation et d'analyse des données de dynamique moléculaire.
- nglview, collection d'outils en ligne pour la visualisation en moléculaire.
- ParmEd, outil général pour l'analyse des systèmes biomoléculaires avec des paquets de simulation populaires.
- PyRETIS, bibliothèque Python pour les simulations d'événements rares, avec une emphase sur l'échantillonnage d'interfaces de transition et d'interfaces de transition avec échange de réplication.