Répertoire /project

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Les espaces projet des systèmes de fichiers sur Cedar et Graham sont organisés selon des groupes à l'aide d'une interface utilisateur simple. L'accès à un espace projet se fait habituellement par des liens symboliques à partir de votre répertoire home. Les liens symboliques se présentent sous le format $HOME/projects/group_name. Dans les comptes de plus longue date, l'autre lien symbolique $HOME/project pointe sur le répertoire projet de votre groupe; pour les utilisateurs qui sont associés à plus d’un groupe, le lien pointe sur le groupe désigné comme étant leur groupe par défaut.

Dans l’espace réservé à un groupe, le chercheur principal est propriétaire du répertoire et les membres du groupe ont des permissions de lecture et écriture pour ce répertoire. Cependant, pour tout nouveau fichier enregistré dans le répertoire, les membres du groupe ont par défaut un droit de lecture seulement; pour que les membres puissent avoir un droit en écriture, la meilleure approche est de créer un répertoire particulier, ainsi

Question.png
[name@server ~]$ mkdir $HOME/projects/def-profname/group_writable

suivi de

Question.png
[name@server ~]$ setfacl -d -m g::rwx $HOME/projects/def-profname/group_writable

Sur le partage de données, la propriété de fichiers et les listes de contrôle d’accès (ACLs), voyez Partage de données.

Par défaut, un espace projet a un quota de 1To et cinq millions de fichiers; l’espace peut être augmenté jusqu’à 10To sur demande auprès du soutien technique. Si votre groupe dispose de quotas plus élevés par suite du concours d’allocation de ressources, vous avez été informé du quota qui vous est alloué pour l’année. Notez que l'espace de stockage alloué dépend de la grappe et ne peut en principe être utilisé sur une autre grappe.

Pour connaitre les espaces utilisés et disponibles pour scratch et projet sur Cedar et Graham, ou l'espace home sur Cedar, utilisez

Question.png
[nom@serveur ~]$ diskusage_report

In order to ensure that files which are copied or moved to a given project space acquire the appropriate group membership - and thus are counted against the expected quota - it can be useful to set the setgid bit on the directory in question. This will have the effect of ensuring that every new file and subdirectory created below the directory will inherit the same group as the ambient directory; equally so, new subdirectories will also possess this same setgid bit. However, existing files and subdirectories will not have their group membership changed - this should be done with the chgrp command - and any files moved to the directory will also continue to retain their existing group membership. You can set the setgid bit on a directory with the command

Question.png
[name@server ~]$ chmod g+s <directory name>

If you want to apply this command to the existing subdirectories of a directory, you can use the command

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[name@server ~]$ find <directory name> -type d -exec chmod g+s '{}' \;

More information on the setgid is available from this page.

You can also use the command newgrp to modify your default group during an interaction session, for example

Question.png
[name@server ~]$ newgrp rrg-profname-ab

and then to copy any data to the appropriate project directory. This will only change your default group for this particular session however - at your next login you will need to reuse the newgrp command if you wish to change the default group again.

Exemple

Dans notre exemple, Sue est chercheur principal et Bob est membre de son groupe. Au départ, les répertoires de Sue et Bob semblent structurés de manière identique.

  • /home/sue/scratch (lien symbolique)
  • /home/sue/projects (répertoire)
  • /home/bob/scratch (lien symbolique)
  • /home/bob/projects (répertoire)

Cependant, le lien symbolique scratch pointe sur des répertoires différents : /scratch/sue pour Sue et /scratch/bob pour Bob.

En supposant que Bob n'ait qu'un seul rôle défini dans la base de données CCDB, le répertoire project de Bob aurait le même contenu que les répertoires project de Sue, et projects pour Bob serait identique à projects pour Sue. Aussi, si Sue et Bob n'ont aucun autre rôle et ne sont associés à aucun autre projet, chacun de leur répertoire projects ne comprendrait qu'un sous-répertoire, soit def-sue.

Chacun de /home/sue/project, /home/bob/project, /home/sue/projects/def-sue et /home/bob/projects/def-sue pointeraient au même répertoire, soit /project/<numéro quelconque>. Ce répertoire est le meilleur endroit où partager les données de Sue et Bob; ils peuvent y créer des répertoires et ont un accès en lecture et en écriture. Ainsi, Sue peut créer un répertoire foo

$ cd ~/projects/def-sue
$ mkdir foo

et Bob peut copier des fichiers dans ~/projects/def-sue/foo, pour que les deux puissent y avoir accès.

En supposant maintenant que Sue a obtenu des ressources avec espace de stockage suite au concours d'allocation de ressources (comme c'est souvent le cas), il y aurait une autre entrée dans leurs répertoires projects respectifs, semblable à

~/projects/rrg-sue-ab

Ce répertoire servirait à stocker et partager les données pour un projet dans le cadre du concours.

Pour partager un fichier avec un utilisateur qui n’est pas parrainé par le chercheur principal, par exemple Heather, le plus simple est de configurer les permissions pour que cet utilisateur puisse lire le répertoire ou le fichier, habituellement par une liste de contrôle des accès (ACL); pour les détails, consultez la page Partage de fichiers. Notez que les permissions pour les systèmes de fichiers peuvent être modifiées pour tous les répertoires ou fichiers, et non seulement pour ceux de votre espace projet. Vous pouvez partager un répertoire de votre espace scratch ou encore un seul sous-répertoire particulier de votre espace projet. Par contre, l’utilisation d’ACLs n’est pas possible pour home sur Graham. Il est de bonne pratique de limiter le partage des fichiers aux espaces projet et scratch.

N’oubliez pas que Heather devra probablement avoir accès à plus d’un niveau de la structure du système de fichiers; il faut lui accorder les permissions de lecture et d’écriture pour chacun des répertoires entre ~/projects/def-sue et le répertoire où sont situés les fichiers à partager. Nous avons supposé que Heather détient un compte sur la grappe en question, mais il est aussi possible de partager des données avec des chercheurs qui n’ont pas de compte avec Calcul Canada, en créant un point de chute commun dans Globus.

Bien sûr, si Heather devient une collaboratrice régulière de Sue, cette dernière pourrait la parrainer et lui accorder les mêmes accès que ceux accordés à Bob.

En résumé :

  • l'espace scratch est utilisé pour les fichiers privés et temporaires
  • l'espace home est habituellement utilisé pour un petit nombre de fichiers relativement privés (par exemple des scripts de tâches)
  • l'espace project du groupe est habituellement utilisé pour les données partagées puisque cet espace est persistant, sauvegardé et plutôt de grande taille (jusqu'à 10To et plus si alloué dans le cadre du concours d'allocation de ressources)