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Revision as of 00:00, 20 October 2022

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Line 489: Line 489:
|-
|-
| contextvars                        || 2.4
| contextvars                        || 2.4
|-
| contourpy                          || 1.0.5
|-
|-
| convertdate                        || 2.4.0
| convertdate                        || 2.4.0
Line 797: Line 799:
|-
|-
| fast5_research                    || 1.2.8
| fast5_research                    || 1.2.8
|-
| fast_ctc_decode                    || 0.3.2
|-
|-
| fasta_reader                      || 0.0.11
| fasta_reader                      || 0.0.11
Line 860: Line 864:
| flask_paginate                    || 2021.10.29, 0.8.1
| flask_paginate                    || 2021.10.29, 0.8.1
|-
|-
| flatbuffers                        || 20190709135844, 2.0, 1.12
| flatbuffers                        || 20190709135844, 22.9.24, 2.0, 1.12
|-
|-
| flatten_dict                      || 0.4.2, 0.3.0
| flatten_dict                      || 0.4.2, 0.3.0
Line 929: Line 933:
|-
|-
| galaxy_sequence_utils              || 1.1.5
| galaxy_sequence_utils              || 1.1.5
|-
| galaxy_tool_util                  || 22.1.2
|-
|-
| gast                              || 0.5.3, 0.5.2, 0.5.0, 0.4.0, 0.3.3, 0.2.2, 0.2.0
| gast                              || 0.5.3, 0.5.2, 0.5.0, 0.4.0, 0.3.3, 0.2.2, 0.2.0
Line 1,466: Line 1,472:
| marshmallow                        || 3.12.2, 3.11.1
| marshmallow                        || 3.12.2, 3.11.1
|-
|-
| matplotlib                        || 3.5.3, 3.5.2, 3.5.1
| matplotlib                        || 3.6.1, 3.5.3, 3.5.2, 3.5.1
|-
|-
| matplotlib_inline                  || 0.1.3, 0.1.2
| matplotlib_inline                  || 0.1.3, 0.1.2
Line 1,511: Line 1,517:
|-
|-
| meshio                            || 4.0.16, 4.0.15
| meshio                            || 4.0.16, 4.0.15
|-
| meson_python                      || 0.10.0
|-
|-
| metabolisHMM                      || 2.22
| metabolisHMM                      || 2.22
Line 1,586: Line 1,594:
| monty                              || 2021.8.17, 2021.7.8, 2021.6.10, 4.0.2, 3.0.2
| monty                              || 2021.8.17, 2021.7.8, 2021.6.10, 4.0.2, 3.0.2
|-
|-
| more_itertools                    || 8.8.0, 8.7.0, 8.6.0, 8.5.0, 8.4.0, 8.2.0, 8.0.2, 7.2.0, 6.0.0, 4.2.0, 4.1.0
| more_itertools                    || 9.0.0, 8.8.0, 8.7.0, 8.6.0, 8.5.0, 8.4.0, 8.2.0, 8.0.2, 7.2.0, 6.0.0, 4.2.0, 4.1.0
|-
|-
| moto                              || 3.1.10, 3.1.4, 3.0.7, 3.0.3, 3.0.2, 2.0.11, 2.0.8, 2.0.7, 2.0.6, 2.0.5, 2.0.4, 1.3.16, 1.3.14, 1.3.7, 1.3.4, 1.3.3, 1.2.0
| moto                              || 3.1.10, 3.1.4, 3.0.7, 3.0.3, 3.0.2, 2.0.11, 2.0.8, 2.0.7, 2.0.6, 2.0.5, 2.0.4, 1.3.16, 1.3.14, 1.3.7, 1.3.4, 1.3.3, 1.2.0
Line 1,814: Line 1,822:
| onnx                              || 1.12.0
| onnx                              || 1.12.0
|-
|-
| ont_bonito                        || 0.5.1
| onnxruntime                        || 1.12.1
|-
| ont_bonito                        || 0.6.1, 0.5.1
|-
|-
| ont_fast5_api                      || 4.0.2, 4.0.0, 3.3.0
| ont_fast5_api                      || 4.0.2, 4.0.0, 3.3.0
|-
| ont_koi                            || 0.1.1
|-
| ont_remora                        || 1.1.1
|-
|-
| openai                            || 0.6.4
| openai                            || 0.6.4
Line 1,896: Line 1,910:
| panaroo                            || 1.2.8, 1.2.4
| panaroo                            || 1.2.8, 1.2.4
|-
|-
| pandas                            || 1.4.1, 1.4.0
| pandas                            || 1.5.0, 1.4.1, 1.4.0
|-
|-
| pandas_flavor                      || 0.2.0
| pandas_flavor                      || 0.2.0
Line 2,055: Line 2,069:
|-
|-
| pmesh                              || 0.1.56
| pmesh                              || 0.1.56
|-
| pod5_format                        || 0.0.32, 0.0.23
|-
| pod5_format_tools                  || 0.0.23
|-
|-
| poetry                            || 1.1.13
| poetry                            || 1.1.13
Line 2,403: Line 2,421:
|-
|-
| pytest_runner                      || 5.3.0, 5.2, 4.2
| pytest_runner                      || 5.3.0, 5.2, 4.2
|-
| pytest_workflow                    || 1.6.0
|-
|-
| pytest_xdist                      || 2.4.0, 2.3.0, 2.2.0
| pytest_xdist                      || 2.4.0, 2.3.0, 2.2.0
Line 2,458: Line 2,478:
| python_utils                      || 2.5.6, 2.4.0, 2.3.0
| python_utils                      || 2.5.6, 2.4.0, 2.3.0
|-
|-
| pythran                            || 0.11.0, 0.10.0, 0.9.12.post1, 0.9.11
| pythran                            || 0.12.0, 0.11.0, 0.10.0, 0.9.12.post1, 0.9.11
|-
|-
| pytimeparse                        || 1.1.8
| pytimeparse                        || 1.1.8
Line 2,599: Line 2,619:
|-
|-
| redis                              || 3.5.3, 3.2.1
| redis                              || 3.5.3, 3.2.1
|-
| refgenie                          || 0.12.1
|-
|-
| regex                              || 2022.1.18
| regex                              || 2022.1.18
Line 2,641: Line 2,663:
|-
|-
| rich                              || 12.5.1, 12.0.1, 11.2.0, 10.10.0, 10.7.0, 10.1.0, 6.1.2
| rich                              || 12.5.1, 12.0.1, 11.2.0, 10.10.0, 10.7.0, 10.1.0, 6.1.2
|-
| rich_click                        || 1.5.2
|-
|-
| rioxarray                          || 0.11.1, 0.10.3, 0.8.0, 0.5.0
| rioxarray                          || 0.11.1, 0.10.3, 0.8.0, 0.5.0
Line 2,752: Line 2,776:
| seqeval                            || 1.2.2
| seqeval                            || 1.2.2
|-
|-
| setuptools                        || 63.2.0, 60.8.1, 60.7.1, 59.5.0, 57.4.0, 57.0.0, 56.2.0, 54.0.0, 53.0.0, 52.0.0, 50.3.2, 50.3.0, 49.6.0, 44.1.1, 44.0.0, 41.6.0, 41.0.1, 40.6.3, 40.0.0, 39.1.0, 39.0.1, 38.2.4, 36.4.0, 36.2.7, 34.1.0
| setuptools                        || 65.5.0, 63.2.0, 60.8.1, 60.7.1, 59.5.0, 57.4.0, 57.0.0, 56.2.0, 54.0.0, 53.0.0, 52.0.0, 50.3.2, 50.3.0, 49.6.0, 44.1.1, 44.0.0, 41.6.0, 41.0.1, 40.6.3, 40.0.0, 39.1.0, 39.0.1, 38.2.4, 36.4.0, 36.2.7, 34.1.0
|-
|-
| setuptools_git                    || 1.2
| setuptools_git                    || 1.2
Line 2,758: Line 2,782:
| setuptools_rust                    || 1.4.1, 1.1.2, 1.0.0, 0.12.1, 0.11.3, 0.10.6, 0.10.3
| setuptools_rust                    || 1.4.1, 1.1.2, 1.0.0, 0.12.1, 0.11.3, 0.10.6, 0.10.3
|-
|-
| setuptools_scm                    || 6.4.2, 5.0.1, 4.1.2, 3.5.0
| setuptools_scm                    || 7.0.5, 6.4.2, 5.0.1, 4.1.2, 3.5.0
|-
|-
| sh                                || 1.14.2, 1.12.14
| sh                                || 1.14.2, 1.12.14
Line 2,978: Line 3,002:
| tensorflow_datasets                || 4.7.0, 4.3.0, 4.2.0
| tensorflow_datasets                || 4.7.0, 4.3.0, 4.2.0
|-
|-
| tensorflow_estimator              || 2.9.0, 2.7.0, 2.6.0, 2.5.0, 2.4.0, 2.3.0, 2.2.0, 2.1.0, 2.0.1, 2.0.0, 1.15.1, 1.14.0, 1.13.0
| tensorflow_estimator              || 2.10.0, 2.9.0, 2.7.0, 2.6.0, 2.5.0, 2.4.0, 2.3.0, 2.2.0, 2.1.0, 2.0.1, 2.0.0, 1.15.1, 1.14.0, 1.13.0
|-
|-
| tensorflow_federated              || 0.17.0
| tensorflow_federated              || 0.17.0
Line 3,089: Line 3,113:
|-
|-
| torchfile                          || 0.1.0
| torchfile                          || 0.1.0
|-
| torchinfo                          || 1.7.1
|-
|-
| torchio                            || 0.18.43, 0.18.29, 0.16.22, 0.16.18
| torchio                            || 0.18.43, 0.18.29, 0.16.22, 0.16.18
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