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BUSCO/fr: Difference between revisions
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*<code>wget</code> | *<code>wget</code> | ||
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===== <b>6.1</b> Téléchargement avec la commande <code>busco</code> ===== | ===== <b>6.1</b> Téléchargement avec la commande <code>busco</code> ===== | ||
Cette option est recommandée. Entrez la commande suivante dans votre répertoire de travail pour télécharger l’ensemble de données, par exemple | Cette option est recommandée. Entrez la commande suivante dans votre répertoire de travail pour télécharger l’ensemble de données, par exemple | ||
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|busco --download bacteria_odb10 | |busco --download bacteria_odb10 | ||
}} | }} | ||
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Il est aussi possible de télécharger plusieurs ensembles de données en une opération en ajoutant les arguments <code>all</code>, <code>prokaryota</code>, <code>eukaryota</code> ou <code>virus</code>, par exemple | Il est aussi possible de télécharger plusieurs ensembles de données en une opération en ajoutant les arguments <code>all</code>, <code>prokaryota</code>, <code>eukaryota</code> ou <code>virus</code>, par exemple | ||
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{{Command|export AUGUSTUS_CONFIG_PATH{{=}}$HOME/augustus_config}} | {{Command|export AUGUSTUS_CONFIG_PATH{{=}}$HOME/augustus_config}} | ||
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====Paramètres SEPP ==== | ====Paramètres SEPP ==== | ||
<b>10.</b> Pour utiliser ces paramètres, SEPP doit être installé localement dans votre environnement virtuel, ce que vous devez faire sur un nœud de connexion. | <b>10.</b> Pour utiliser ces paramètres, SEPP doit être installé localement dans votre environnement virtuel, ce que vous devez faire sur un nœud de connexion. | ||
</div> | |||
<b>10.1.</b> Activez votre environnement virtuel BUSCO. | <b>10.1.</b> Activez votre environnement virtuel BUSCO. | ||