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Points de contrôle/en: Difference between revisions
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** Once the atomic write has been completed, one can choose whether or not to delete any older checkpoints. | ** Once the atomic write has been completed, one can choose whether or not to delete any older checkpoints. | ||
<div class="mw-translate-fuzzy"> | |||
So as not to re-invent the wheel, particularly in situations where modifying the source code isn't an option, an alternative solution is the use of the software | So as not to re-invent the wheel, particularly in situations where modifying the source code isn't an option, an alternative solution is the use of the software | ||
[http://dmtcp.sourceforge.net/ DMTCP]. | [http://dmtcp.sourceforge.net/ DMTCP]. | ||
</div> | |||
Le logiciel [http://dmtcp.sourceforge.net/ DMTCP] (Distributed Multithreaded CheckPointing) permet de faire des points de contrôles de programmes sans avoir à les recompiler. Pour pouvoir l’utiliser, il faut charger le module DMTCP. La première exécution est effectuée avec le programme <tt>dmtcp_launch</tt> en spécifiant le temps entre les intervalles de sauvegarde. Le redémarrage se fait en exécutant le script <tt>dmtcp_restart_script.sh</tt>. Par défaut, ce script et les fichiers de redémarrage du programme sont écrits à l'endroit où le programme a été lancé. On peut changer l’emplacement des fichiers de sauvegarde avec l’option <tt>--ckptdir <répertoire pour les sauvegardes></tt>. Vous pouvez faire <tt>dmtcp_launch --help</tt> pour obtenir toutes les options. Notez que DMTCP ne marche pas pour le moment avec les logiciels parallélisés par MPI. | |||
Un exemple de script: | |||
{{Fichier | {{Fichier | ||
|name=job_with_dmtcp.sh | |name=job_with_dmtcp.sh | ||
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# --------------------------------------------------------------------- | # --------------------------------------------------------------------- | ||
}} | }} | ||
--> | |||
== Resubmitting a Job for Long-Running Computations == | == Resubmitting a Job for Long-Running Computations == | ||
If you plan on breaking up a lengthy computation into several Slurm jobs, there are [[Running_jobs#Resubmitting_jobs_for_long_running_computations|two recommended methods]]: | If you plan on breaking up a lengthy computation into several Slurm jobs, there are [[Running_jobs#Resubmitting_jobs_for_long_running_computations|two recommended methods]]: | ||
* [[Running_jobs#Restarting_using_job_arrays|using Slurm job arrays]]; | * [[Running_jobs#Restarting_using_job_arrays|using Slurm job arrays]]; | ||
* [[Running_jobs#Resubmission_from_the_job_script|resubmission from the end of the job script]]. | * [[Running_jobs#Resubmission_from_the_job_script|resubmission from the end of the job script]]. | ||