Star-CCM+/fr: Difference between revisions

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Vous pouvez acheter une licence POD (<i>Power On Demand</i>) directement de [https://www.plm.automation.siemens.com/global/en/buy/ Siemens]. Autrement, vous pouvez utiliser une licence locale hébergée par votre établissement pourvu que le pare-feu permette à la grappe où les tâches seront exécutées d'y accéder.
Vous pouvez acheter une licence POD (<i>Power On Demand</i>) directement de [https://www.plm.automation.siemens.com/global/en/buy/ Siemens]. Autrement, vous pouvez utiliser une licence locale hébergée par votre établissement pourvu que le pare-feu permette à la grappe où les tâches seront exécutées d'y accéder.


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== Utilisation de votre propre serveur de licence ==
== Utilisation de votre propre serveur de licence ==
Afin de configurer votre compte pour utiliser votre propre serveur de licence, créez le fichier  <code>$HOME/.licenses/starccm.lic</code> qui contient  
Afin de configurer votre compte pour utiliser votre propre serveur de licence, créez le fichier  <code>$HOME/.licenses/starccm.lic</code> qui contient  
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USE_SERVER}}
USE_SERVER}}
où <code>IP</code> et <code>PORT</code> sont remplacés par l'adresse IP et le port de votre serveur de licence.
où <code>IP</code> et <code>PORT</code> sont remplacés par l'adresse IP et le port de votre serveur de licence.
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=== Fichier pour une licence POD ===
=== Fichier pour une licence POD ===


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Si vous disposez d'une licence POD de [https://www.plm.automation.siemens.com/global/en/buy/ Siemens] configurez le fichier <code>$HOME/.licenses/starccm.lic</code> sur la ou les grappes où les tâches seront exécutées.
Si vous disposez d'une licence POD de [https://www.plm.automation.siemens.com/global/en/buy/ Siemens] configurez le fichier <code>$HOME/.licenses/starccm.lic</code> sur la ou les grappes où les tâches seront exécutées.
{{File|name=starccm.lic|contents=SERVER flex.cd-adapco.com ANY 1999
{{File|name=starccm.lic|contents=SERVER flex.cd-adapco.com ANY 1999
USE_SERVER}}
USE_SERVER}}
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= Soumettre des tâches en lot sur nos grappes =  
= Soumettre des tâches en lot sur nos grappes =  
Sélectionnez l’un des modules disponibles, selon vos besoins :
Sélectionnez l’un des modules disponibles, selon vos besoins :
* <code>starccm</code> pour le format double précision,
* <code>starccm</code> pour le format double précision,
* <code>starccm-mixed</code> pour le format précision mixte.
* <code>starccm-mixed</code> pour le format précision mixte.
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Vous devrez aussi configurer votre environnement pour l’utilisation de votre licence. Cette opération est plutôt simple si vous utilisez le serveur CD-adapco qui vous permet de payer uniquement pour votre consommation. Par contre, si vous utilisez un serveur de licence interne, contactez le [[Technical support/fr|soutien technique]] pour obtenir de l'aide.  
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Vous devrez aussi configurer votre environnement pour l’utilisation de votre licence. Cette opération est plutôt simple si vous utilisez le serveur CD-adapco qui vous permet de payer uniquement pour votre consommation. Par contre, si vous utilisez un serveur de licence interne, contactez le [[Technical support/fr|soutien technique]] pour obtenir de l'aide.
Sur [[Niagara/fr|Niagara]], les nœuds de calcul configurent le système de fichiers <code>$HOME</code> en lecture seule (<i>read only</i>). Il est donc important de définir la variable d'environnement <code>$STARCCM_TMP</code> et de la diriger vers <code>$SCRATCH</code>, ce qui est unique à la version de StarCCM+. Autrement, StarCCM+ tente de créer le répertoire dans <code>$HOME</code> et se termine de façon anormale.
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NCORE=$((SLURM_NNODES * SLURM_CPUS_PER_TASK * SLURM_NTASKS_PER_NODE))
NCORE=$((SLURM_NNODES * SLURM_CPUS_PER_TASK * SLURM_NTASKS_PER_NODE))


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# supprimez <i>-power -podkey $LM_PROJECT</i> si vous utilisez un serveur de licence de votre établissement
# supprimez <i>-power -podkey $LM_PROJECT</i> si vous utilisez un serveur de licence de votre établissement
starccm+ -batch -power -podkey $LM_PROJECT -np $NCORE -licpath $CDLMD_LICENSE_FILE -machinefile $STARCCM_TMP/machinefile-$SLURM_JOB_ID $PWD/your-file.sim
starccm+ -batch -power -podkey $LM_PROJECT -np $NCORE -licpath $CDLMD_LICENSE_FILE -machinefile $STARCCM_TMP/machinefile-$SLURM_JOB_ID $PWD/your-file.sim
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NCORE=$((SLURM_NNODES * SLURM_CPUS_PER_TASK * SLURM_NTASKS_PER_NODE))
NCORE=$((SLURM_NNODES * SLURM_CPUS_PER_TASK * SLURM_NTASKS_PER_NODE))


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# supprimez <i>-power -podkey $LM_PROJECT</i> si vous utilisez un serveur de licence de votre établissement
# supprimez <i>-power -podkey $LM_PROJECT</i> si vous utilisez un serveur de licence de votre établissement
starccm+ -batch -power -podkey $LM_PROJECT -np $NCORE -licpath $CDLMD_LICENSE_FILE -machinefile $STARCCM_TMP/machinefile-$SLURM_JOB_ID $PWD/your-file.sim -mpi intel -fabric psm2
starccm+ -batch -power -podkey $LM_PROJECT -np $NCORE -licpath $CDLMD_LICENSE_FILE -machinefile $STARCCM_TMP/machinefile-$SLURM_JOB_ID $PWD/your-file.sim -mpi intel -fabric psm2
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export CDLMD_LICENSE_FILE="1999@flex.cd-adapco.com"
export CDLMD_LICENSE_FILE="1999@flex.cd-adapco.com"


export STARCCM_TMP="${SCRATCH}/.starccm-${EBVERSIONSTARCCM}"
<div class="mw-translate-fuzzy">
mkdir -p "$STARCCM_TMP"
 
slurm_hl2hl.py --format STAR-CCM+ > $STARCCM_TMP/machinefile-$SLURM_JOB_ID
slurm_hl2hl.py --format STAR-CCM+ > $STARCCM_TMP/machinefile-$SLURM_JOB_ID
</div>


NCORE=$((SLURM_NNODES * SLURM_CPUS_PER_TASK * SLURM_NTASKS_PER_NODE))
NCORE=$((SLURM_NNODES * SLURM_CPUS_PER_TASK * SLURM_NTASKS_PER_NODE))


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# supprimez <i>-power -podkey $LM_PROJECT</i> si vous utilisez un serveur de licence de votre établissement
# supprimez <i>-power -podkey $LM_PROJECT</i> si vous utilisez un serveur de licence de votre établissement
starccm+ -jvmargs -Xmx4G -jvmargs -Djava.io.tmpdir=$SLURM_TMPDIR -batch -power -podkey $LM_PROJECT -np $NCORE -licpath $CDLMD_LICENSE_FILE -machinefile $STARCCM_TMP/machinefile-$SLURM_JOB_ID $PWD/your-file.sim -mpi intel -fabric psm2
starccm+ -jvmargs -Xmx4G -jvmargs -Djava.io.tmpdir=$SLURM_TMPDIR -batch -power -podkey $LM_PROJECT -np $NCORE -licpath $CDLMD_LICENSE_FILE -machinefile $STARCCM_TMP/machinefile-$SLURM_JOB_ID $PWD/your-file.sim -mpi intel -fabric psm2
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}}</tab>
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NCORE=$((SLURM_NNODES * SLURM_CPUS_PER_TASK * SLURM_NTASKS_PER_NODE))
NCORE=$((SLURM_NNODES * SLURM_CPUS_PER_TASK * SLURM_NTASKS_PER_NODE))


<div class="mw-translate-fuzzy">
# supprimez <i>-power -podkey $LM_PROJECT</i> si vous utilisez un serveur de licence de votre établissement
# supprimez <i>-power -podkey $LM_PROJECT</i> si vous utilisez un serveur de licence de votre établissement
starccm+ -jvmargs -Xmx4G -jvmargs -Djava.io.tmpdir=$SLURM_TMPDIR -batch -power -podkey $LM_PROJECT -np $NCORE -licpath $CDLMD_LICENSE_FILE -machinefile $STARCCM_TMP/machinefile-$SLURM_JOB_ID $PWD/your-file.sim -mpi openmpi
starccm+ -jvmargs -Xmx4G -jvmargs -Djava.io.tmpdir=$SLURM_TMPDIR -batch -power -podkey $LM_PROJECT -np $NCORE -licpath $CDLMD_LICENSE_FILE -machinefile $STARCCM_TMP/machinefile-$SLURM_JOB_ID $PWD/your-file.sim -mpi openmpi
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}}
}}
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ssh nia-gw -L 1999:flex.cd-adapco.com:1999 -L 2099:flex.cd-adapco.com:2099 -N -f
ssh nia-gw -L 1999:flex.cd-adapco.com:1999 -L 2099:flex.cd-adapco.com:2099 -N -f


<div class="mw-translate-fuzzy">
cd $SLURM_SUBMIT_DIR
cd $SLURM_SUBMIT_DIR
slurm_hl2hl.py --format STAR-CCM+ > $SLURM_SUBMIT_DIR/machinefile_$SLURM_JOB_ID
slurm_hl2hl.py --format STAR-CCM+ > $SLURM_SUBMIT_DIR/machinefile_$SLURM_JOB_ID
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= Visualisation à distance =
= Visualisation à distance =

Revision as of 22:21, 22 July 2024

Other languages:

STAR-CCM+ est une suite logicielle de simulation utilisée dans plusieurs spécialités de génie. Elle permet la modélisation dans des domaines variés dont l'acoustique, la dynamique des fluides, le transfert thermique, la rhéologie, l'écoulement polyphasique, le flux de particules, la mécanique des solides, les fluides réactifs, l'électrochimie et l'électromagnétisme.

Limites de la licence

Les binaires STAR-CCM+ sont installés sur nos serveurs, mais nous n'avons pas de licence pour utilisation générale; vous devez donc posséder votre propre licence. Vous pouvez acheter une licence POD (Power On Demand) directement de Siemens. Autrement, vous pouvez utiliser une licence locale hébergée par votre établissement pourvu que le pare-feu permette à la grappe où les tâches seront exécutées d'y accéder.

Utilisation de votre propre serveur de licence

Afin de configurer votre compte pour utiliser votre propre serveur de licence, créez le fichier $HOME/.licenses/starccm.lic qui contient

File : starccm.lic

SERVER IP ANY PORT
USE_SERVER


où IP et PORT sont remplacés par l'adresse IP et le port de votre serveur de licence.

Fichier pour une licence POD

Si vous disposez d'une licence POD de Siemens configurez le fichier $HOME/.licenses/starccm.lic sur la ou les grappes où les tâches seront exécutées.

File : starccm.lic

SERVER flex.cd-adapco.com ANY 1999
USE_SERVER


Soumettre des tâches en lot sur nos grappes

Sélectionnez l’un des modules disponibles, selon vos besoins :

  • starccm pour le format double précision,
  • starccm-mixed pour le format précision mixte.

Vous devrez aussi configurer votre environnement pour l’utilisation de votre licence. Cette opération est plutôt simple si vous utilisez le serveur CD-adapco qui vous permet de payer uniquement pour votre consommation. Par contre, si vous utilisez un serveur de licence interne, contactez le soutien technique pour obtenir de l'aide.

File : starccm_job.sh

#!/bin/bash

#SBATCH --account=def-group   # indiquez le nom du compte
#SBATCH --time=00-01:00       # indiquez la limite de temps (jj-hh:mm)
#SBATCH --nodes=1             # indiquez 1 ou plusieurs nœuds
#SBATCH --cpus-per-task=40    # demandez tous les cœurs par nœud
#SBATCH --mem=0               # demandez toute la mémoire par nœud
#SBATCH --ntasks-per-node=1   # ne pas modifier

#module load StdEnv/2020      # Versions < 18.06.006
module load StdEnv/2023

#module load starccm/18.06.006-R8
module load starccm-mixed/18.06.006

export LM_PROJECT='YOUR CD-ADAPCO PROJECT ID GOES HERE'
export CDLMD_LICENSE_FILE="1999@flex.cd-adapco.com"

export STARCCM_TMP="${SCRATCH}/.starccm-${EBVERSIONSTARCCM}"
mkdir -p "$STARCCM_TMP"

slurm_hl2hl.py --format STAR-CCM+ > $STARCCM_TMP/machinefile-$SLURM_JOB_ID

NCORE=$((SLURM_NNODES * SLURM_CPUS_PER_TASK * SLURM_NTASKS_PER_NODE))

<div class="mw-translate-fuzzy">
# supprimez <i>-power -podkey $LM_PROJECT</i> si vous utilisez un serveur de licence de votre établissement
starccm+ -batch -power -podkey $LM_PROJECT -np $NCORE -licpath $CDLMD_LICENSE_FILE -machinefile $STARCCM_TMP/machinefile-$SLURM_JOB_ID $PWD/your-file.sim
</div>
File : starccm_job.sh

#!/bin/bash

#SBATCH --account=def-group   # indiquez le nom du compte
#SBATCH --time=00-01:00       # indiquez la limite de temps (jj-hh:mm)
#SBATCH --nodes=1             # indiquez 1 ou plusieurs nœuds
#SBATCH --cpus-per-task=48    # (ou 32) demandez tous les cœurs par nœud
#SBATCH --mem=0               # demandez toute la mémoire par nœud
#SBATCH --ntasks-per-node=1   # ne pas modifier

#module load StdEnv/2020      # Versions < 18.06.006
module load StdEnv/2023

#module load starccm/18.06.006-R8
module load starccm-mixed/18.06.006

export LM_PROJECT='YOUR CD-ADAPCO PROJECT ID GOES HERE'
export CDLMD_LICENSE_FILE="1999@flex.cd-adapco.com"

export STARCCM_TMP="${SCRATCH}/.starccm-${EBVERSIONSTARCCM}"
mkdir -p "$STARCCM_TMP"

slurm_hl2hl.py --format STAR-CCM+ > $STARCCM_TMP/machinefile-$SLURM_JOB_ID

NCORE=$((SLURM_NNODES * SLURM_CPUS_PER_TASK * SLURM_NTASKS_PER_NODE))

<div class="mw-translate-fuzzy">
# supprimez <i>-power -podkey $LM_PROJECT</i> si vous utilisez un serveur de licence de votre établissement
starccm+ -batch -power -podkey $LM_PROJECT -np $NCORE -licpath $CDLMD_LICENSE_FILE -machinefile $STARCCM_TMP/machinefile-$SLURM_JOB_ID $PWD/your-file.sim -mpi intel -fabric psm2
</div>
File : starccm_job.sh

#!/bin/bash

#SBATCH --account=def-group   # indiquez le nom du compte
#SBATCH --time=00-01:00       # indiquez la limite de temps (jj-hh:mm)
#SBATCH --nodes=1             # indiquez 1 ou plusieurs nœuds
#SBATCH --cpus-per-task=32    # (ou 44) demandez tous les cœurs par nœud
#SBATCH --mem=0               # demandez toute la mémoire par nœud
#SBATCH --ntasks-per-node=1   # ne pas modifier

#module load StdEnv/2020      # Versions < 18.06.006
module load StdEnv/2023

#module load starccm/18.06.006-R8
module load starccm-mixed/18.06.006

export LM_PROJECT='YOUR CD-ADAPCO PROJECT ID GOES HERE'
export CDLMD_LICENSE_FILE="1999@flex.cd-adapco.com"

<div class="mw-translate-fuzzy">
slurm_hl2hl.py --format STAR-CCM+ > $STARCCM_TMP/machinefile-$SLURM_JOB_ID
</div>

NCORE=$((SLURM_NNODES * SLURM_CPUS_PER_TASK * SLURM_NTASKS_PER_NODE))

<div class="mw-translate-fuzzy">
# supprimez <i>-power -podkey $LM_PROJECT</i> si vous utilisez un serveur de licence de votre établissement
starccm+ -jvmargs -Xmx4G -jvmargs -Djava.io.tmpdir=$SLURM_TMPDIR -batch -power -podkey $LM_PROJECT -np $NCORE -licpath $CDLMD_LICENSE_FILE -machinefile $STARCCM_TMP/machinefile-$SLURM_JOB_ID $PWD/your-file.sim -mpi intel -fabric psm2
</div>
File : starccm_job.sh

#!/bin/bash

#SBATCH --account=def-group   # indiquez le nom du compte
#SBATCH --time=00-01:00       # indiquez la limite de temps (jj-hh:mm)
#SBATCH --nodes=1             # indiquez 1 ou plusieurs nœuds
#SBATCH --cpus-per-task=64    # demandez tous les cœurs par nœud
#SBATCH --mem=0               # demandez toute la mémoire par nœud
#SBATCH --ntasks-per-node=1   # ne pas modifier

#module load StdEnv/2020      # Versions < 18.06.006
module load StdEnv/2023

#module load starccm/18.06.006-R8
module load starccm-mixed/18.06.006

export LM_PROJECT='YOUR CD-ADAPCO PROJECT ID GOES HERE'
export CDLMD_LICENSE_FILE="1999@flex.cd-adapco.com"

export STARCCM_TMP="${SCRATCH}/.starccm-${EBVERSIONSTARCCM}"
mkdir -p "$STARCCM_TMP"

slurm_hl2hl.py --format STAR-CCM+ > $STARCCM_TMP/machinefile-$SLURM_JOB_ID

NCORE=$((SLURM_NNODES * SLURM_CPUS_PER_TASK * SLURM_NTASKS_PER_NODE))

<div class="mw-translate-fuzzy">
# supprimez <i>-power -podkey $LM_PROJECT</i> si vous utilisez un serveur de licence de votre établissement
starccm+ -jvmargs -Xmx4G -jvmargs -Djava.io.tmpdir=$SLURM_TMPDIR -batch -power -podkey $LM_PROJECT -np $NCORE -licpath $CDLMD_LICENSE_FILE -machinefile $STARCCM_TMP/machinefile-$SLURM_JOB_ID $PWD/your-file.sim -mpi openmpi
</div>


File : starccm_job.sh

#!/bin/bash

#SBATCH --account=def-group   # indiquez le nom du compte
#SBATCH --time=00-01:00       # indiquez la limite de temps (jj-hh:mm)
#SBATCH --nodes=1             # indiquez 1 ou plusieurs nœuds
#SBATCH --cpus-per-task=40    # demandez tous les cœurs par nœud
#SBATCH --mem=0               # demandez toute la mémoire par nœud
#SBATCH --ntasks-per-node=1   # ne pas modifier
#SBATCH --mail-type=BEGIN
#SBATCH --mail-type=END
 
module load CCEnv

#module load StdEnv/2020      # Versions < 18.06.006
module load StdEnv/2023

#module load starccm/18.06.006-R8
module load starccm-mixed/18.06.006

export LM_PROJECT='YOUR CD-ADAPCO PROJECT ID GOES HERE'
export CDLMD_LICENSE_FILE="1999@127.0.0.1"

ssh nia-gw -L 1999:flex.cd-adapco.com:1999 -L 2099:flex.cd-adapco.com:2099 -N -f

<div class="mw-translate-fuzzy">
cd $SLURM_SUBMIT_DIR
slurm_hl2hl.py --format STAR-CCM+ > $SLURM_SUBMIT_DIR/machinefile_$SLURM_JOB_ID
 
NCORE=$((SLURM_NNODES * SLURM_CPUS_PER_TASK * SLURM_NTASKS_PER_NODE))
 
# Solution en cas d'échec de la licence : 
# jusqu'à ce que l'état en sortie soit égal à zéro, nous tentons de lancer Star-CCM+ (ici, au moins 5 fois)
i=1
RET=-1
while [ $i -le 5 ] && [ $RET -ne 0 ]; do
        [ $i -eq 1 ] || sleep 5
        echo "Attempt number: "$I
        # si vous utilisez un serveur de licence de votre établissement, supprimez "-power -podkey $LM_PROJECT"
        starccm+ -batch -power -podkey $LM_PROJECT -np $NCORE -machinefile $SLURM_SUBMIT_DIR/machinefile_$SLURM_JOB_ID $SLURM_SUBMIT_DIR/your-simulation-file.java $SLURM_SUBMIT_DIR/your-simulation-file.sim > $SLURM_JOB_ID.results
        RET=$?
        i=$((i+1))
   done
exit $RET


Visualisation à distance

Préparation

Configurez votre compte pour visualiser à distance :

  1. Créez le fichier de licence ~/.licenses/starccm.lic comme décrit ci-dessus.
  2. Si vous avez une licence POD (Power-on-demand),
configurez export LM_PROJECT='CD-ADAPCO PROJECT ID' et
ajoutez -power aux autres options ligne de commande, comme montré ci-dessous.

Nœuds de calcul

Connectez-vous à un nœud avec TigerVNC et ouvrez une fenêtre de terminal, puis

STAR-CCM+ 15.04.010 (ou versions plus récentes)
module load StdEnv/2020
module load starccm-mixed/17.02.007 **OU** starccm/16.04.007-R8
starccm+
STAR-CCM+ 14.06.010, 14.04.013, 14.02.012
module load StdEnv/2016
module load starccm-mixed/14.06.010 **OU** starccm/14.06.010-R8
starccm+
STAR-CCM+ 13.06.012 (ou versions moins récentes)
module load StdEnv/2016
module load starccm-mixed/13.06.012 **OU** starccm/13.06.012-R8
starccm+ -mesa

Nœuds VDI

Connectez-vous à gra-vdi avec TigerVNC et connectez-vous. Quand le bureau distant est affiché, cliquez sur ouvrez une fenêtre de terminal (Applications-->Systems Tools-->Mate Terminal) pour ouvrir une fenêtre de terminal et indiquez la version de Star-CCM que vous voulez charger (voir ci-dessous). Si voous avez déjà chargé un StdEnv, vous pouvez faire afficher les versions disponibles avec la commande module avail starccm-mixed. Présentement, seulement l'implémentation MESA de OpenGL peut être utilisée sur gra-vdi avec starccm en raison de problèmes avec virtualgl qui offre l'accélération des GPU locaux pour les graphiques OpenGL.

STAR-CCM+ 18.04.008 (ou versions plus récentes)
module load CcEnv StdEnv/2023
module load starccm-mixed/18.04.008 **OR** starccm/18.04.008-R8
starccm+ -mesa
STAR-CCM+ 15.04.010 --> 18.02.008 (de version X jusqu'à version Y)
module load CcEnv StdEnv/2020
module load starccm-mixed/15.04.010 **OR** starccm/15.04.010-R8
starccm+ -mesa
STAR-CCM+ 13.06.012 (ou versions moins récentes)
module load CcEnv StdEnv/2016
module load starccm-mixed/13.06.012 **OR** starccm/13.06.012-R8
starccm+ -mesa
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