Galaxy/fr: Difference between revisions

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=== Structure du répertoire ===
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Galaxy is usually installed on the project directory of the group and it contains several sub-directories. The name of the Galaxy top directory is determined by taking the first two character of PI username + "glxy". For example if PI username is "davidc" the Galaxy top directory will be "daglxy" and it is located in <code>/project/group name/</code> where <code>group name</code> is the default group name of PI, eg., <code>def-davidc</code>. Galaxy main directory contains the following sub-directories which is slightly different than the original Galaxy package.
L’installation se fait habituellement dans le répertoire /project du groupe de recherche. Le nom du répertoire source est formé par les deux premiers caractères du nom de la chercheuse ou du chercheur principal (CP), auxquels est ajouté ''glxy''. Par exemple, pour le CP ''davidc'', le nom du répertoire source sera ''daglxy''; le répertoire sera localisé dans <tt>/project/group name/</tt> où ''group name'' est le nom du groupe par défaut pour ce CP (<tt>def-davidc</tt>). Le répertoire principal pour Galaxy contient un ensemble de sous-répertoires qui est quelque peu différent du paquet Galaxy original, soit :


* '''config''': contains all required configuration files to set up and optimize the Galaxy server. Below we explain some basic concepts of some of the configuration files that need to be set up in order to be compatible with our HPC environment, however, we will not cover all concepts.   
* '''config''': contains all required configuration files to set up and optimize the Galaxy server. Below we explain some basic concepts of some of the configuration files that need to be set up in order to be compatible with our HPC environment, however, we will not cover all concepts.   
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