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Le système de fichiers CVFMS (''shared software distribution system'') rend presque tous les logiciels disponibles sur les nouvelles grappes. Sous Linux, les logiciels seraient installés dans <code>/usr/bin</code>, <code>/usr/include</code> et ainsi de suite, alors que dans notre cas, ils sont installées de manière identique sur toutes les nouvelles grappes sous <code>/cvmfs/soft.computecanada.ca</code>. | Le système de fichiers CVFMS (''shared software distribution system'') rend presque tous les logiciels disponibles sur les nouvelles grappes. Sous Linux, les logiciels seraient installés dans <code>/usr/bin</code>, <code>/usr/include</code> et ainsi de suite, alors que dans notre cas, ils sont installées de manière identique sur toutes les nouvelles grappes sous <code>/cvmfs/soft.computecanada.ca</code>. | ||
Le module <code>nixpkgs/16.09</code> est chargé par défaut et agit comme cœur pour la pile logicielle gérée par le gestionnaire de paquets Nic situé sous <code>/cvmfs/soft.computecanada.ca/nix/var/nix/profiles/16.09</code>. | |||
Indiquez ce chemin avec la variable d'environnement <code>$EBROOTNIXPKGS</code>. À cet endroit se trouvent tous les paquets usuels fournis dans un environnement Linux, par <code>make</code>, <code>ls</code>, <code>cat</code>, <code>grep</code>. À la compilation d'un logiciel, le compilateur et l'éditeur de liens cherchent typiquement les fichiers d'entête et les librairies à l'endroit approprié (avec les variables d'environnement <code>$CPATH</code> et <code>$LIBRARY_PATH</code> respectivement). | |||
Cependant, dans le cas de certains logiciels, <code>/usr</code> est explicitement indiqué; si c'est le cas, la compilation s'arrête et vous devrez spécifier <code>$EBROOTNIXPKGS</code>. Il faudra quelquefois ajuster un Makefile, passer un indicateur <code>--with-</code> via le script de compilation ou éditer un fichier de configuration. Si vous ne savez pas comment procéder, contactez le soutien technique. | |||
Similarly, if a package depends on a library that is provided by a module other than <code>nixpkgs</code>, you may need to provide the location of the header files and libraries of that module. The EBROOT convention applies to all modules, e.g. the HDF5 library is installed in <code>$EBROOTHDF5</code>, and its <code>include</code> and <code>lib</code> subdirectories once you <code>module load hdf5</code>. | Similarly, if a package depends on a library that is provided by a module other than <code>nixpkgs</code>, you may need to provide the location of the header files and libraries of that module. The EBROOT convention applies to all modules, e.g. the HDF5 library is installed in <code>$EBROOTHDF5</code>, and its <code>include</code> and <code>lib</code> subdirectories once you <code>module load hdf5</code>. |