Installing software in your home directory/fr: Difference between revisions

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Le système de fichiers CVFMS (''shared software distribution system'') rend presque tous les logiciels disponibles sur les nouvelles grappes. Sous Linux, les logiciels seraient installés dans <code>/usr/bin</code>, <code>/usr/include</code> et ainsi de suite, alors que dans notre cas, ils sont installées de manière identique sur toutes les nouvelles grappes sous  <code>/cvmfs/soft.computecanada.ca</code>.
Le système de fichiers CVFMS (''shared software distribution system'') rend presque tous les logiciels disponibles sur les nouvelles grappes. Sous Linux, les logiciels seraient installés dans <code>/usr/bin</code>, <code>/usr/include</code> et ainsi de suite, alors que dans notre cas, ils sont installées de manière identique sur toutes les nouvelles grappes sous  <code>/cvmfs/soft.computecanada.ca</code>.


The core of this software stack is provided by the <code>nixpkgs/16.09</code> module, which is loaded by default. This software stack, internally managed using the Nix package manager, is located at <code>/cvmfs/soft.computecanada.ca/nix/var/nix/profiles/16.09</code>. The environment variable <code>$EBROOTNIXPKGS</code> should be used to refer to this path.
Le module <code>nixpkgs/16.09</code> est chargé par défaut et agit comme cœur pour la pile logicielle gérée par le gestionnaire de paquets Nic situé sous <code>/cvmfs/soft.computecanada.ca/nix/var/nix/profiles/16.09</code>.
Under this location you can find all of the common packages typically included with Linux distributions, for instance <code>make</code>, <code>ls</code>, <code>cat</code>, <code>grep</code>, and so on. Typically, when you compile some software, the compiler and linker will automatically look for header files and libraries in the right location (via the environment variables <code>$CPATH</code> and <code>$LIBRARY_PATH</code>, respectively).
 
Some software, however, has been hardcoded to look under <code>/usr</code>. If that is the case, the compilation will typically fail, and needs to be explicitly told about <code>$EBROOTNIXPKGS</code>. Sometimes that means adjusting a Makefile, sometimes it needs to be specified in a certain <code>--with-</code> flag for the configure script, or a configuration file needs to be edited. If you are not sure how to do this please do not hesitate to ask for help.
Indiquez ce chemin avec la variable d'environnement <code>$EBROOTNIXPKGS</code>. À cet endroit se trouvent tous les paquets usuels fournis dans un environnement Linux, par <code>make</code>, <code>ls</code>, <code>cat</code>, <code>grep</code>. À la compilation d'un logiciel, le compilateur et l'éditeur de liens cherchent typiquement les fichiers d'entête et les librairies à l'endroit approprié (avec les variables d'environnement <code>$CPATH</code> et <code>$LIBRARY_PATH</code> respectivement).  
 
Cependant, dans le cas de certains logiciels, <code>/usr</code> est explicitement indiqué; si c'est le cas, la compilation s'arrête et vous devrez spécifier <code>$EBROOTNIXPKGS</code>. Il faudra quelquefois ajuster un Makefile, passer un indicateur <code>--with-</code> via le script de compilation ou éditer un fichier de configuration. Si vous ne savez pas comment procéder, contactez le soutien technique.


Similarly, if a package depends on a library that is provided by a module other than <code>nixpkgs</code>, you may need to provide the location of the header files and libraries of that module. The EBROOT convention applies to all modules, e.g. the HDF5 library is installed in <code>$EBROOTHDF5</code>, and its <code>include</code> and <code>lib</code> subdirectories once you <code>module load hdf5</code>.
Similarly, if a package depends on a library that is provided by a module other than <code>nixpkgs</code>, you may need to provide the location of the header files and libraries of that module. The EBROOT convention applies to all modules, e.g. the HDF5 library is installed in <code>$EBROOTHDF5</code>, and its <code>include</code> and <code>lib</code> subdirectories once you <code>module load hdf5</code>.
Diane27
rsnt_translations
56,430

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