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9 December 2024
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Created page with "=== Exemple === Voici un exemple simple d'un script de soumission d'une tâche : {{File |name=qiime2-example.sh |lang="bash" |contents= #!/bin/bash #SBATCH --account=def-someprof # adjust this to match the accounting group you are using to submit jobs #SBATCH --mem-per-cpu=4096M # adjust this according to the memory you need #SBATCH --cpus-per-task=1 # adjust this according to the number of core you need #SBATCH --time=08:00:00 # adjust th..."
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29 November 2024
9 January 2024
2 August 2023
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Created page with "{{Callout |title=Note |content=Étant donné que la commande <tt>qiime</tt> appelle un conteneur, il se peut que vous deviez définir la variable d'environnement <tt>APPTAINER_BIND</tt> pour ... des répertoires particuliers dans ce conteneur pour avoir accès à vos données, par exemple <tt>APPTAINER_BIND=/home qiime ...</tt> }}"
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Created page with "Une fois le module chargé, vous pouvez lancer {{Command|qiime --help}}"
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Created page with "== Module pour QIIME2 == QIIME2 est disponible en chargeant un module qui enveloppe un conteneur. Pour connaître les versions disponibles, lancez {{Command|module spider qiime2}}"
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26 July 2023
25 July 2023
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Created page with "<b>Remarque </b>: QIIME 2 a remplacé QIIME 1 en janvier 2018; la version 1 n'est plus supportée."
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17 July 2023
23 February 2022
18 February 2022
7 February 2022
7 July 2021
10 March 2020
9 March 2020
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Created page with "Notez qu'il est important de faire un bind mount entre les répertoires avec lesquels vous voulez travailler et l'exécution du conteneur. Pour..."
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24 February 2020
19 February 2020
Created page with "Cette étape du build pourrait prendre plus d'une heure, mais il ne faut l'effectuer qu'une seule fois. Sauvegardez le fichier image (dans notre exemple <code>qiime2-2019.10.s..."
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Created page with "'''Note : Depuis février 2020, il n'est pas possible d'installer QIIME avec Anaconda ou Miniconda en raison de plusieurs problèmes dus aux environnements Conda.'''"
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Created page with "Votre script SBATCH ressemblerait à"
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