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BUSCO/fr: Difference between revisions
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Created page with "Tous les fichiers doivent être décompressés avec <code>tar -xvf file.tar.gz</code>. {{Commands |mkdir -p busco_downloads/lineages |cd busco_downloads/lineages |wget https://busco-data.ezlab.org/v5/data/lineages/bacteria_odb10.2020-03-06.tar.gz |tar -xvf bacteria_odb10.2020-03-06.tar.gz }}"
(Created page with "Tous les fichiers de lignées se trouveront alors dans <b>busco_downloads/lineages/</b>. La présence de <code>--download_path busco_downloads/</code> dans la ligne de commande BUSCO indiquera où trouver l’argument <code>--lineage_dataset bacteria_odb10</code> pour l'ensemble de données. Si <i>busco_download</i> n’est pas votre répertoire de travail, il faudra fournir le chemin complet.") |
(Created page with "Tous les fichiers doivent être décompressés avec <code>tar -xvf file.tar.gz</code>. {{Commands |mkdir -p busco_downloads/lineages |cd busco_downloads/lineages |wget https://busco-data.ezlab.org/v5/data/lineages/bacteria_odb10.2020-03-06.tar.gz |tar -xvf bacteria_odb10.2020-03-06.tar.gz }}") |
||
| Line 97: | Line 97: | ||
=====<b>6.2</b> Téléchargement avec la commande <code>wget</code> ===== | =====<b>6.2</b> Téléchargement avec la commande <code>wget</code> ===== | ||
Tous les fichiers doivent être décompressés avec <code>tar -xvf file.tar.gz</code>. | |||
{{Commands | {{Commands | ||
|mkdir -p busco_downloads/lineages | |mkdir -p busco_downloads/lineages | ||
| Line 105: | Line 105: | ||
}} | }} | ||
<b>4.</b> Copiez le répertoire de configuration d’Augustus à un endroit accessible en écriture. | <b>4.</b> Copiez le répertoire de configuration d’Augustus à un endroit accessible en écriture. | ||
{{Command|cp -r $EBROOTAUGUSTUS/config $HOME/augustus_config}} | {{Command|cp -r $EBROOTAUGUSTUS/config $HOME/augustus_config}} | ||
{{Commands | {{Commands | ||