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Installing software in your home directory/fr: Difference between revisions
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== Paquets Python, R et Perl == | == Paquets Python, R et Perl == | ||
Les langages Python, R, et Perl offrent d'importantes librairies d'extensions; presque toutes peuvent être facilement installées dans votre répertoire home. Consultez les pages [https://docs.computecanada.ca/wiki/Python/fr Python], [https://docs.computecanada.ca/wiki/R/fr R] et [https://docs.computecanada.ca/wiki/Perl Perl] pour savoir si le paquet dont vous avez besoin est disponible; si ce n'est pas le cas, vous trouverez aussi dans cette documentation l'information nécessaire pour l’installer par vous-même. | Les langages Python, R, et Perl offrent d'importantes librairies d'extensions; presque toutes peuvent être facilement installées dans votre répertoire home. Consultez les pages [https://docs.computecanada.ca/wiki/Python/fr Python], [https://docs.computecanada.ca/wiki/R/fr R] et [https://docs.computecanada.ca/wiki/Perl Perl] pour savoir si le paquet dont vous avez besoin est disponible; si ce n'est pas le cas, vous trouverez aussi dans cette documentation l'information nécessaire pour l’installer par vous-même. | ||
== Installing binary packages == | |||
If you install pre-compiled binaries in your home directory (for example [https://conda.io/miniconda.html Miniconda]) they may fail using errors such as <code>/lib64/libc.so.6: version `GLIBC_2.18' not found</code>. Often such binaries can be patched using our <code>setrpaths.sh</code> script, using the syntax <code>setrpaths.sh --path path [--add_origin]</code> where path refers to the directory where you installed that software. This script will make sure that the binaries use the correct interpreter, and search for the libraries they are dynamically linked to in the correct folder. The option <code>--add_origin</code> will also add $ORIGIN to the RUNPATH. This is sometimes helpful if the library cannot find other libraries in the same folder as itself. | |||
== La pile logicielle de Calcul Canada == | == La pile logicielle de Calcul Canada == | ||
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Si un fichier entête ou une librairie habituellement offert dans une distribution de type Linux par un RPM ou autre gestionnaire de paquets ne se trouve ni par <code>nixpkgs</code>, ni par un autre module, veuillez nous en informer; nous pourrons très probablement l'ajouter. | Si un fichier entête ou une librairie habituellement offert dans une distribution de type Linux par un RPM ou autre gestionnaire de paquets ne se trouve ni par <code>nixpkgs</code>, ni par un autre module, veuillez nous en informer; nous pourrons très probablement l'ajouter. | ||
<div class="mw-translate-fuzzy"> | |||
'''Notes''' | '''Notes''' | ||
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* Si vous installez des binaires précompilés dans votre répertoire home (par exemple [https://conda.io/miniconda.html Miniconda]), vous pourriez recevoir une erreur telle que <code>/lib64/libc.so.6: version `GLIBC_2.18' not found</code>. Ces binaires peuvent souvent être réparés avec le script <code>setrpaths.sh</code> en utilisant la syntaxe <code>setrpaths.sh --path path [--add_origin]</code> où path désigne le répertoire où vous avez installé le logiciel. Ce script fait en sorte que les binaires utilisent le bon interpréteur et cherche les librairies auxquelles ils sont dynamiquement liés dans le répertoire approprié. L'option <code>--add_origin</code> ajoute aussi $ORIGIN au RUNPATH, ce qui peut s'avérer utile si la librairie ne peut trouver d'autres librairies situées dans le même répertoire qu'elle-même. | * Si vous installez des binaires précompilés dans votre répertoire home (par exemple [https://conda.io/miniconda.html Miniconda]), vous pourriez recevoir une erreur telle que <code>/lib64/libc.so.6: version `GLIBC_2.18' not found</code>. Ces binaires peuvent souvent être réparés avec le script <code>setrpaths.sh</code> en utilisant la syntaxe <code>setrpaths.sh --path path [--add_origin]</code> où path désigne le répertoire où vous avez installé le logiciel. Ce script fait en sorte que les binaires utilisent le bon interpréteur et cherche les librairies auxquelles ils sont dynamiquement liés dans le répertoire approprié. L'option <code>--add_origin</code> ajoute aussi $ORIGIN au RUNPATH, ce qui peut s'avérer utile si la librairie ne peut trouver d'autres librairies situées dans le même répertoire qu'elle-même. | ||
* En dernier recours, utilisez <code>module --force purge</code> pour éliminer l'environnement CVMFS. Vous obtiendrez ainsi une installation CentOS-7 brute, sans modules. Ceci peut servir dans des cas spéciaux où vous compilez GCC par vous-même ou quand vous utilisez des chaines d'outils de compilation comme [http://www.astro.wisc.edu/~townsend/static.php?ref=mesasdk MESA SDK]. Il ne serait nécessaire de purger des modules qu'à la compilation et ils peuvent être chargés à nouveau au lancement du logiciel. | * En dernier recours, utilisez <code>module --force purge</code> pour éliminer l'environnement CVMFS. Vous obtiendrez ainsi une installation CentOS-7 brute, sans modules. Ceci peut servir dans des cas spéciaux où vous compilez GCC par vous-même ou quand vous utilisez des chaines d'outils de compilation comme [http://www.astro.wisc.edu/~townsend/static.php?ref=mesasdk MESA SDK]. Il ne serait nécessaire de purger des modules qu'à la compilation et ils peuvent être chargés à nouveau au lancement du logiciel. | ||
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