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Line 16: | Line 16: | ||
Nous pourrons alors vous donner accès à Gaussian. | Nous pourrons alors vous donner accès à Gaussian. | ||
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==Utiliser Gaussian sur Graham== | ==Utiliser Gaussian sur Graham== | ||
Les versions g16.a03, g09.e01 et g03.d01 sont installées sur la nouvelle grappe Graham et sont disponibles via le système de modules. Chargez l'application avec l'une ou l'autre des commandes suivantes : | Les versions g16.a03, g09.e01 et g03.d01 sont installées sur la nouvelle grappe Graham et sont disponibles via le système de modules. Chargez l'application avec l'une ou l'autre des commandes suivantes : | ||
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===Soumettre des tâches=== | ===Soumettre des tâches=== | ||
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====g16 (g09, g03) pour les tâches régulières==== | ====g16 (g09, g03) pour les tâches régulières==== | ||
<div class="mw-translate-fuzzy"> | |||
Avec cette option, les fichiers d'exécution (.rwf, .inp, .d2e, .int, .skr) sont enregistrés dans votre espace scratch local personnel (/localscratch/username/), sur le nœud de calcul où la tâche est exécutée. Par la suite, l'ordonnanceur supprime les fichiers dans l'espace scratch local; pour en garder la trace, il est recommandé aux utilisateurs de noter le numéro du nœud de calcul. | Avec cette option, les fichiers d'exécution (.rwf, .inp, .d2e, .int, .skr) sont enregistrés dans votre espace scratch local personnel (/localscratch/username/), sur le nœud de calcul où la tâche est exécutée. Par la suite, l'ordonnanceur supprime les fichiers dans l'espace scratch local; pour en garder la trace, il est recommandé aux utilisateurs de noter le numéro du nœud de calcul. | ||
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Voici un exemple d'un script g16 (pour g09 ou g03, modifiez simplement la ligne pour le chargement du module et changez g16 pour g09 ou g03). | Voici un exemple d'un script g16 (pour g09 ou g03, modifiez simplement la ligne pour le chargement du module et changez g16 pour g09 ou g03). | ||
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#SBATCH --time=02-00:00 # expect run time (DD-HH:MM) | #SBATCH --time=02-00:00 # expect run time (DD-HH:MM) | ||
#SBATCH --cpus-per-task=16 # No. of cpus for the job as defined by %nprocs in the name.com file | #SBATCH --cpus-per-task=16 # No. of cpus for the job as defined by %nprocs in the name.com file | ||
#SBATCH --output=name.log # output file | |||
module load gaussian/g16.a03 | module load gaussian/g16.a03 | ||
G16 name.com # G16 command, input: name.com, output: name.log by default | G16 name.com # G16 command, input: name.com, output: name.log by default |