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Ces directives permettent d'installer Jupyter Notebook avec la commande <code>pip</code> dans un [[Python/fr#Cr.C3.A9er_et_utiliser_un_environnement_virtuel|environnement virtuel Python]] dans votre répertoire personnel (''home''). Les directives sont valides pour la version 3.6 de Python, mais vous pouvez installer l'application pour d'autres versions en chargeant le module Python approprié. | Ces directives permettent d'installer Jupyter Notebook avec la commande <code>pip</code> dans un [[Python/fr#Cr.C3.A9er_et_utiliser_un_environnement_virtuel|environnement virtuel Python]] dans votre répertoire personnel (''home''). Les directives sont valides pour la version 3.6 de Python, mais vous pouvez installer l'application pour d'autres versions en chargeant le module Python approprié. | ||
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#Chargez le module Python. | #Chargez le module Python. | ||
#:{{Command2|module load python/3.6}} | #:{{Command2|module load python/3.6}} | ||
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|chmod u+x $VIRTUAL_ENV/bin/notebook.sh | |chmod u+x $VIRTUAL_ENV/bin/notebook.sh | ||
}} | }} | ||
</div> | |||
== Installer des modules d'extension == | == Installer des modules d'extension == | ||
Line 187: | Line 189: | ||
'''Avant d'installer un ''kernel'' Anaconda''', lisez la documentation et installez [[Anaconda/fr|Anaconda]]. | '''Avant d'installer un ''kernel'' Anaconda''', lisez la documentation et installez [[Anaconda/fr|Anaconda]]. | ||
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# Chargez le module Anaconda. {{Command2|module load miniconda3}} | # Chargez le module Anaconda. {{Command2|module load miniconda3}} | ||
# '''Optionnel''' : Activez un environnement conda particulier en remplaçant <code><your_env> par le nom que vous voulez donner à votre environnement virtuel Anaconda</code>{{Command2|source activate <your_env>}} | # '''Optionnel''' : Activez un environnement conda particulier en remplaçant <code><your_env> par le nom que vous voulez donner à votre environnement virtuel Anaconda</code>{{Command2|source activate <your_env>}} | ||
Line 192: | Line 195: | ||
# Générez le fichier de configuration du noyau (''kernel'') en remplaçant <code><unique_name></code> par un nom unique pour le noyau. {{Command2|python -m ipykernel install --user --name <unique_name> --display-name "My Anaconda 3 Kernel"}} | # Générez le fichier de configuration du noyau (''kernel'') en remplaçant <code><unique_name></code> par un nom unique pour le noyau. {{Command2|python -m ipykernel install --user --name <unique_name> --display-name "My Anaconda 3 Kernel"}} | ||
# '''Optionnel''' : Désactivez l'environnement virtuel. {{Command2|source deactivate}} | # '''Optionnel''' : Désactivez l'environnement virtuel. {{Command2|source deactivate}} | ||
</div> | |||
Pour plus d'information, consultez la [http://ipython.readthedocs.io/en/stable/install/kernel_install.html documentation IPython kernel]. | Pour plus d'information, consultez la [http://ipython.readthedocs.io/en/stable/install/kernel_install.html documentation IPython kernel]. | ||
Line 197: | Line 201: | ||
=== Julia === | === Julia === | ||
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# Chargez le module [[Julia]]. {{Command2|module load julia}} | # Chargez le module [[Julia]]. {{Command2|module load julia}} | ||
# Activez l'environnement virtuel Jupyter Notebook. {{Command2|source $HOME/jupyter_py3/bin/activate}} | # Activez l'environnement virtuel Jupyter Notebook. {{Command2|source $HOME/jupyter_py3/bin/activate}} | ||
# Installez IJulia. {{Command2|prompt=(jupyter_py3)_[name@server ~]$|echo 'Pkg.add("IJulia")' {{!}} julia}} | # Installez IJulia. {{Command2|prompt=(jupyter_py3)_[name@server ~]$|echo 'Pkg.add("IJulia")' {{!}} julia}} | ||
</div> | |||
Pour plus d'information, consultez la [https://github.com/JuliaLang/IJulia.jl documentation IJulia]. | Pour plus d'information, consultez la [https://github.com/JuliaLang/IJulia.jl documentation IJulia]. | ||
Line 205: | Line 211: | ||
=== Python === | === Python === | ||
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# Chargez le module Python. {{Command2|module load python/3.5}} | # Chargez le module Python. {{Command2|module load python/3.5}} | ||
# Créez un nouvel environnement Python. {{Command2|virtualenv $HOME/jupyter_py3.5}} | # Créez un nouvel environnement Python. {{Command2|virtualenv $HOME/jupyter_py3.5}} | ||
Line 211: | Line 218: | ||
# Generate the kernel spec file. Remplacez <code><unique_name></code> par un nom unique pour votre noyau. {{Command2|python -m ipykernel install --user --name <unique_name> --display-name "Python 3.5 Kernel"}} | # Generate the kernel spec file. Remplacez <code><unique_name></code> par un nom unique pour votre noyau. {{Command2|python -m ipykernel install --user --name <unique_name> --display-name "Python 3.5 Kernel"}} | ||
# Désactivez l'environnement virtuel. {{Command2|source deactivate}} | # Désactivez l'environnement virtuel. {{Command2|source deactivate}} | ||
</div> | |||
Pour plus d'information, voyez la information, see the [http://ipython.readthedocs.io/en/stable/install/kernel_install.html documentation ipykernel]. | Pour plus d'information, voyez la information, see the [http://ipython.readthedocs.io/en/stable/install/kernel_install.html documentation ipykernel]. | ||
=== R === | === R === | ||
<div class="mw-translate-fuzzy"> | |||
# Chargez le module R. {{Command2|module load r}} | # Chargez le module R. {{Command2|module load r}} | ||
# Activez l'environnement virtuel Jupyter Notebook. {{Command2|source $HOME/jupyter_py3/bin/activate}} | # Activez l'environnement virtuel Jupyter Notebook. {{Command2|source $HOME/jupyter_py3/bin/activate}} | ||
Line 222: | Line 230: | ||
# Installez le ''kernel'' R. {{Command2|prompt=(jupyter_py3)_[name@server ~]$|R -e "devtools::install_github(paste0('IRkernel/', c('repr', 'IRdisplay', 'IRkernel')))"}} | # Installez le ''kernel'' R. {{Command2|prompt=(jupyter_py3)_[name@server ~]$|R -e "devtools::install_github(paste0('IRkernel/', c('repr', 'IRdisplay', 'IRkernel')))"}} | ||
# Installez le fichier de configuration du noyau (''kernel'') R. {{Command2|prompt=(jupyter_py3)_[name@server ~]$|R -e "IRkernel::installspec()"}} | # Installez le fichier de configuration du noyau (''kernel'') R. {{Command2|prompt=(jupyter_py3)_[name@server ~]$|R -e "IRkernel::installspec()"}} | ||
</div> | |||
Pour plus d'information, consultez la [https://irkernel.github.io/docs/ documentation IRKernel]. | Pour plus d'information, consultez la [https://irkernel.github.io/docs/ documentation IRKernel]. | ||
== Références == | == Références == |