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QIIME (pour ''Quantitative Insights Into [https://fr.wikipedia.org/wiki/%C3%89cologie_microbienne Microbial Ecology]'') est un pipeline bio-informatique open-source pour l’analyse de [https://fr.wikipedia.org/wiki/Microbiome microbiomes]. À partir de données brutes de séquençage d’ADN générées par des plateformes comme [https://www.illumina.com/ Illumina], QIIME produit des graphiques et statistiques de haute qualité pour, entre autres, le démultiplexage, le filtrage de qualité, la sélection d’OTU, l’attribution taxonomique, la reconstruction philogénétique et l’analyse de la diversité. | |||
'''NOTE''' : Le 1er janvier 2018, QIIME 2 a remplacé QIIME 1 qui est depuis obsolète. | '''NOTE''' : Le 1er janvier 2018, QIIME 2 a remplacé QIIME 1 qui est depuis obsolète. |