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[https://mafft.cbrc.jp/alignment/software/ MAFFT] est un programme d'alignement de séquences multiples pour des systèmes d'exploitation comme Unix. Il offre plusieurs méthodes d'alignement dont (précis, pour l'alignement de <∼200 séquences), FFT-NS-2 (rapide, pour l'alignement de <∼30,000 séquences), etc. | [https://mafft.cbrc.jp/alignment/software/ MAFFT] est un programme d'alignement de séquences multiples pour des systèmes d'exploitation comme Unix. Il offre plusieurs méthodes d'alignement dont (précis, pour l'alignement de <∼200 séquences), FFT-NS-2 (rapide, pour l'alignement de <∼30,000 séquences), etc. | ||
== | == Nœud unique == | ||
MAFFT | MAFFT profite de cœurs multiples sur des nœuds uniques; voir https://mafft.cbrc.jp/alignment/software/multithreading.html. | ||
'''Note''': The <tt>MAFFT_TMPDIR</tt> is set to <tt>$SLURM_TMPDIR/maffttmp</tt> when you load the module. | '''Note''': The <tt>MAFFT_TMPDIR</tt> is set to <tt>$SLURM_TMPDIR/maffttmp</tt> when you load the module. | ||