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Dans certaines situations, la complexité des dépendances d'un logiciel exige une solution où l'on peut maîtriser entièrement l'environnement. Pour ces situations, on recommande l'outil Apptainer : notez qu'une image Docker peut être convertie en image Apptainer. Le seul inconvénient de Apptainer, c'est que les images consomment beaucoup d'espace disque, alors si votre groupe de recherche prévoit d'utiliser plusieurs images, il serait sage de les regrouper ensemble dans un seul répertoire de l'espace projet du groupe pour éviter les doublons.