Galaxy/fr: Difference between revisions

Les fichiers d’une instance Galaxy appartiennent à un ''pseudo-compte'', qui est un compte partagé créé à l’installation par un administrateur. Un tel compte n’est la propriété individuelle de personne, mais appartient plutôt à un groupe particulier. Les personnes faisant partie du groupe peuvent se connecter au compte via les [[SSH Keys/fr |clés SSH]]. Le nom du pseudo-compte est le même que celui du répertoire source; dans le cas de l’exemple utilisé ci-dessus, ce nom serait ''daglxy''. Pour pouvoir modifier les fichiers de l’instance, par exemple les fichiers de configuration, vous devez vous connecter au pseudo-compte. Pour ce faire, il faut d’abord générer une paire de clés SSH, enregistrer votre clé publique dans votre répertoire /home et en informer l’administrateur qui placera votre clé publique au bon endroit.

Starting Galaxy server is the first thing that needs to be done by users. Galaxy server should NOT be run on cedar login node or any compute node. We have a dedicated server called  "gateway" and it is used for this purpose. It contains a web server with relevant Cedar filesystems, <code>/project</code> and <code>/home</code> directories mounted on it. Users cannot make a SSH connection to this machine due to security reasons, however we have designed a web site on this machine that allows users to start/stop  their own galaxy server. The website also allows users to user Galaxy web interface to communicate with the server. To do that please go to the website [https://gateway.cedar.computecanada.ca/ https://gateway.cedar.computecanada.ca/] and click on Galaxy link. You will be asked to enter your username and password. Your username and password is the same as your computecanada one. Once you authenticate then you will be automatically redirect to your galaxy server manager website where you can manage your server or use Galaxy web interface.