Galaxy/fr: Difference between revisions

Les fichiers d’une instance Galaxy appartiennent à un ''pseudo-compte'', qui est un compte partagé créé à l’installation par un administrateur. Un tel compte n’est la propriété individuelle de personne, mais appartient plutôt à un groupe particulier. Les personnes faisant partie du groupe peuvent se connecter au compte via les [[SSH Keys/fr |clés SSH]]. Le nom du pseudo-compte est le même que celui du répertoire source; dans le cas de l’exemple utilisé ci-dessus, ce nom serait ''daglxy''. Pour pouvoir modifier les fichiers de l’instance, par exemple les fichiers de configuration, vous devez vous connecter au pseudo-compte. Pour ce faire, il faut d’abord générer une paire de clés SSH, enregistrer votre clé publique dans votre répertoire /home et en informer l’administrateur qui placera votre clé publique au bon endroit.

La première chose à faire est de démarrer le serveur Galaxy. Ce serveur ne doit pas être utilisé sur un nœud de calcul, ni un nœud de connexion de Cedar, mais plutôt sur un serveur dédié appelé « passerelle » (''gateway''). La passerelle contient un serveur web avec les répertoires /project et /home ainsi que les systèmes de fichiers particuliers à Cedar. Il n'est pas possible de s'y connecter par SSH pour des raisons de sécurité, mais le serveur Galaxy peut être démarré et arrêté via un site web que nous avons conçu. Par ce site, vous pouvez aussi accéder à l’interface web du serveur Galaxy.