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QIIME (pour <i>Quantitative Insights Into [https://fr.wikipedia.org/wiki/%C3%89cologie_microbienne Microbial Ecology]</i>) est un pipeline bioinformatique open source pour l’analyse de [https://fr.wikipedia.org/wiki/Microbiome microbiomes]. À partir de données brutes de séquençage d’ADN générées par des plateformes comme [https://www.illumina.com/ Illumina], QIIME produit des graphiques et statistiques de haute qualité pour, entre autres, le démultiplexage, le filtrage de qualité, la sélection d’OTU, l’attribution taxonomique, la reconstruction phylogénétique et l’analyse de la diversité. | |||
QIIME (pour | |||
<b>Note</b>: QIIME 2 has replaced QIIME 1 as of January 1, 2018; version 1 is no longer supported. | <b>Note</b>: QIIME 2 has replaced QIIME 1 as of January 1, 2018; version 1 is no longer supported. |