BUSCO/fr: Difference between revisions

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(Created page with "Pour plusieurs génomes, le répertoire genome/ doit se trouver dans le répertoire courant, autrement il faut donner le chemin complet :")
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{{Command|busco --offline --in genome/ --out TEST --lineage_dataset bacteria_odb10 --mode genome --cpu ${SLURM_CPUS_PER_TASK:-1} --download_path busco_download/}}
{{Command|busco --offline --in genome/ --out TEST --lineage_dataset bacteria_odb10 --mode genome --cpu ${SLURM_CPUS_PER_TASK:-1} --download_path busco_download/}}


<div class="mw-translate-fuzzy">
La commande pour un seul génome devrait être exécutée sous les 60 secondes. Les tâches de production qui nécessitent plus de temps doivent être [[Running jobs/fr|soumises à l'ordonnanceur]].
Cette commande devrait prendre moins de 60 secondes. Les tâches dont la production est plus longue doivent être [[Running jobs/fr|soumises à l'ordonnanceur]].
</div>


<div class="mw-translate-fuzzy">
===== Conseils pour BUSCO =====
== Versions disponibles ==
Les versions récentes sont disponibles dans des <i>wheels</i> et la plus ancienne version dans un module (voir la section Modules ci-dessous).
</div>


Specify <code>--in genome.fna</code> for single file analysis.  
Specify <code>--in genome.fna</code> for single file analysis.  
rsnt_translations
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