rsnt_translations
56,430
edits
(Created page with "Pour plusieurs génomes, le répertoire genome/ doit se trouver dans le répertoire courant, autrement il faut donner le chemin complet :") |
No edit summary |
||
Line 122: | Line 122: | ||
{{Command|busco --offline --in genome/ --out TEST --lineage_dataset bacteria_odb10 --mode genome --cpu ${SLURM_CPUS_PER_TASK:-1} --download_path busco_download/}} | {{Command|busco --offline --in genome/ --out TEST --lineage_dataset bacteria_odb10 --mode genome --cpu ${SLURM_CPUS_PER_TASK:-1} --download_path busco_download/}} | ||
La commande pour un seul génome devrait être exécutée sous les 60 secondes. Les tâches de production qui nécessitent plus de temps doivent être [[Running jobs/fr|soumises à l'ordonnanceur]]. | |||
===== Conseils pour BUSCO ===== | |||
== | |||
Specify <code>--in genome.fna</code> for single file analysis. | Specify <code>--in genome.fna</code> for single file analysis. |