BUSCO/fr: Difference between revisions

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Created page with "<b>10.1.</b> Activez votre environnement virtuel BUSCO. {{Commands |source busco_env/bin/activate }}"
(Created page with "*Assurez-vous de définir la variable d'environnement <code>AUGUSTUS_CONFIG_PATH</code>. {{Command|export AUGUSTUS_CONFIG_PATH{{=}}$HOME/augustus_config}}")
(Created page with "<b>10.1.</b> Activez votre environnement virtuel BUSCO. {{Commands |source busco_env/bin/activate }}")
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{{Command|export AUGUSTUS_CONFIG_PATH{{=}}$HOME/augustus_config}}
{{Command|export AUGUSTUS_CONFIG_PATH{{=}}$HOME/augustus_config}}


====SEPP parameters====
====Paramètres SEPP ====
<b>10.</b> To use SEPP parameters, you need to install SEPP locally in your virtual environment. This should be done in a login node.
<b>10.</b> Pour utiliser ces paramètres, SEPP doit être installé localement dans votre environnement virtuel, ce que vous devez faire sur un nœud de connexion.


<b>10.1.</b> Activate your BUSCO virtual environment.
<b>10.1.</b> Activez votre environnement virtuel BUSCO.
{{Commands
{{Commands
|source busco_env/bin/activate
|source busco_env/bin/activate
}}
}}


<b>10.2.</b> Install DendroPy.
<b>10.2.</b> Installez DendroPy.
{{Commands
{{Commands
|pip install 'dendropy<4.6'
|pip install 'dendropy<4.6'
}}
}}


<b>10.3.</b> Install SEPP.
<b>10.3.</b> Installez SEPP.
{{Commands
{{Commands
|git clone https://github.com/smirarab/sepp.git
|git clone https://github.com/smirarab/sepp.git
rsnt_translations
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